eICU-CRD、MIMIC 3数据集 详解

已于 2024-05-22 15:28:57 修改
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分类专栏： # KG图神经网络GNN、GCN、GCT 知识图谱KnowledgeGraph 文章标签： 大语言模型 人工智能 claude3 图神经网络 图卷积transformer
于 2024-03-17 12:06:59 首次发布
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MIMIC-III数据集介绍 - 危症监测
强化学习曾小健
02-23 1787
CHARTEVENTS是最重要的一张表,记录的大部分是患者生命体征的数据,如心率,血压,体温等等.该表是通过患者编号\病案号和ICU编号作为联合主键确定患者．项目标志符也就是item_id,比如心率这个项目所对应的项目标识符可以在d_labitems字典中查到.记录时间和存储时间是对应该项的存储时间.记录时间可以用于筛选特定的时间窗口(比如说进入ICU24小时内的数据).要用到前面的ICUSTAYS的入科时间以及当前测量的时间做差值,从而确定研究队列.住院时长即在ICU中待的时间的长度.
[论文解读]CPLLM：使用大型语言模型进行临床预测CPLLM: Clinical Prediction with Large Language Models 数据集eICU、MIMIC 3等EHR数
强化学习曾小健
03-17 1807
我们提出了使用大语言模型进行临床预测（CPLLM），这是一种对预先训练的大语言模型（大语言模型）进行微调以进行临床疾病预测的方法。我们利用量化并根据提示对大语言模型进行微调，其任务是利用患者的历史诊断记录来预测患者在下次就诊或随后的诊断中是否会被诊断出目标疾病。我们将我们的结果与各种基线进行了比较，包括Logistic 回归、RETAIN 和 Med-BERT，这是使用结构化 EHR 数据进行疾病预测的当前最先进的模型。
eICU数据集提取病症教程
qq_44297664的博客
11-16 994
有没有想用eICU数据库提取临床数据的，如果需求人多的话，可以出一篇教程。
eICU数据导入postgresSQL方法
qq_44297664的博客
04-22 1304
总共5GB左右，下载完毕后，将所有压缩文件进行解压，共31个csv表格，解压后共30多GB，我的eICU数据集存放的地址：H:\eICU\eICUdata。如果你的Navicat连接了postgre，那么在Navicat里便可以看到eICU的这些表。地址：https://github.com/mit-lcp/eicu-code。检查数据库内容是否安装正确，全都PASSED则表示全都安装正确。②解压后的eICU数据文件：H:\eICU\eICUdata。①4个sql文件：E:\eicu_load_sql。
医疗数据大集结
最新发布
Debroon
03-19 1427
上表主要聚焦中文数据集(和少量混合)，其中个别英文数据集或多语数据集也附在最后以便参考。更多“英文”数据集将在后文的**“1.2 英文/多语言数据集”**或“其他附录”中进一步列出。当前出现了大量专注“图像+文本多模态”的医疗模型与评测，主要解决放射学影像、内窥镜图像、病理图像等结合文字报告的多模态理解、问答和生成。的医疗/生物医学相关数据集，涵盖问答、对话、知识图谱、文本抽取等任务。除上述大语言模型及数据集外，以下是一些常见的。
eICU数据库中各个数据表的详细含义
数说时代
10-16 1385
eICU数据库中各个数据表的详细含义这些表格共同提供了病人从入院到出院期间的完整护理和治疗过程的详细记录，涵盖药物、实验室检查、诊断、护理和治疗等多个方面。
MIMIC-III数据集介绍
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qq_43787862的博客
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Data Descriptor:MIMIC-III, a freely accessible critical care database 这篇paper是对MIMIC-III数据集的一个介绍，不涉及研究内容，故按照论文本身的框架来总结。
mimic-iii数据库说明-01数据库介绍
wjgyy808的博客
06-11 6144
mimic-iii数据库说明-中文版
eICU-demo数据集
强化学习曾小健
04-11 2032
阿利斯泰尔·约翰逊 、 汤姆·波拉德 , 奥马尔·巴达维 , 杰西·拉法 发布日期：2021 年 5 月 6 日。版本：2.0.1使用此资源时，请引用：（ 显示更多选项） Johnson, A.、Pollard, T.、Badawi, O. 和 Raffa, J. (2021)。 eICU 协作研究数据库演示（版本 2.0.1）。生理网。eICU Collaborative Research Database Demo v2.0.1。请附上 PhysioNet 的标准引文：（ 显示更多选项） G
MIMIC III数据集详细介绍
bboy枫亭的博客
10-29 2万+
文章目录1. 概述2. 字典信息辅助表D_CPT（目前使用医疗服务术语表）D_ICD_DIAGNOSES （ICD病情确诊词典表）D_ICD_PROCEDURES （ICD医疗过程词典表）D_ITEMS（ＩＣＵ化验词典表）D_LABITEMS（门诊化验词典表）3. 病人基本信息及转移信息表PATIENTS（病人登记表）ADMISSIONS（住院表）CALLOUT（出院表）ICUSTAYS（ICU记录表）TRANSFERS（病房转移表）SERVICES（服务表）4. 病人医院门诊治疗的相关信息表CPTEVEN
eicu-code：与eICU合作研究数据库相关的代码和网站
02-05
eICU协作研究数据库代码存储库 这是研究社区共享的代码库。 该存储库旨在成为共享，完善和重用用于分析的代码的中央枢纽。 要了解有关数据库的更多信息，请访问： : 如何贡献 我们的团队一直在努力创建和共享eICU...
eICU-GNN-LSTM：基于图表示学习预测患者结果的Python代码库
eICU-GNN-LSTM项目的核心理念是将患者的医疗数据构建成图结构，从而更好地捕捉和表示患者间以及患者与疾病之间的复杂关系。图神经网络在处理图结构数据方面具有天然的优势，能够考虑到节点之间的复杂交互，例如不同...
医学数据库MIMIC-III v1.4
05-01
多参数智能监测数据库（ＭＩＭＩＣ－ＩＩＩ）是一个免费开放的、公共资源的重症监护室研究数据库。 内容概要：本资源包含数据集中的三个表格，PATIENTS，CHARTEVENTS和LABEVENTS，表格的说明可参考 https://mimic.physionet.org/mimictables/patients/ https://mimic.physionet.org/mimictables/chartevents/ https://mimic.physionet.org/mimictables/labevents/ 适合人群：机器学习相关研究人员
eicu-data-paper:eICU合作研究数据库的数据描述符，可提交给科学数据
04-27
eICU协作研究数据库数据描述符 eICU协作研究数据库的数据描述符，可提交给科学数据。 可以生成一个生成所有表格的笔记本： 。 文件包含提交的源LaTeX。
eICU协作研究数据库：代码共享与分析工具集
总结来说，给定的文件信息表明了eICU协作研究数据库代码存储库的存在，它旨在收集和共享用于分析医疗数据集的代码，特别是那些与eICU-CRD有关的。该存储库强调了代码共享的重要性，并为研究者提供了一个协作和贡献的...
EICU数据库安装教程
zfxgfcjhb的博客
07-20 3790
1.创建数据库：CREATE USER EICU with password ' '; CREATE DATABASE EICU OWNER EICU; 2.连接数据库： \c eicu 3.创建模式并设置搜索路径：create schema eicuiii; set search_path to eicuiii; 4.创建数据库中的表：\i E:/datat...
MIMIC-III数据库的介绍
weixin_45081871的博客
04-09 4352
MIMIC-III(Medical Information Mart for Intensive Care III)是一个由MIT负责管理的基于重症监护室病人监测情况的医学开源数据集。 MIMIC-III包含了2001年至2012年期间入住ICU的成年患者（16岁或以上）的53423例不同住院患者的数据，还包含2001至2008年期间接纳的7870例新生儿的数据。 26张数据表 摘录自论文《基于机器学习的重症监护病患死亡率预测》 ...
本地Windows MIMIC III数据入库
一叶知秋
08-02 2940
本地MIMIC III数据库入库，用以医疗数据分析，算法优化
MIMIC数据集结构
weixin_49286924的博客
03-01 193
是
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