Analyzing Neural Time Series Data Chapter6

阅读笔记，仅作学习记录用途。

本章介绍如何设计实验的细节，使它们适合于基于时频的分析。许多原理细节要等到后续章节展开。

Part I: Introduction

6 Practicalities of EEG Measurement and Experiment Design

6.2 Event Markers 事件标记

Experiment event markers(亦称triggers）是从刺激传递计算机发送到脑电图放大器的方波脉冲。

通常在原始数据文件中记录为一个单独的通道（有时多个）。

其振幅用来编码特定的事件。通常8-pin cables可支持最多255个唯一codes（默认情况下，0表示无标记）

在导入数据时，这些marker会被转换为带有标签的时间戳，以指示实验中不同事件发生的时间。

 （以上图为例，event marker 是垂直线，上标数字代表特定的事件，对应时刻和事件对应值的正确获取非常重要）

Event marker 被用于离线锁时EEG数据。

也被用来重建不同的条件和反应。

宜多不宜少，在分析过程中很容易折叠多个标记。

特定的试验事件没有被编码在数据文件中时，可能很难重建。

注意数据采集系统有没有同时发送的marker被覆盖。

注意每个marker的持续时间：

至少需要包括几个采样，（0.5ms对应500Hz采样率可能就不会被记录）；

但过长时间的marker会与其他marker存在交叠。

向受试者传递刺激，向EEG采集系统传递event marker的软件包：

Presentation  （commercial）

E-Prime （commercial）

Psychophysics toolbox or Cogent （Matlab toolbox）

6.3 Intra- and Intertrial Timing 试验内事件间隔和试验间间隔

Intra Timing :

最好将试验中的实验事件之间相隔至少数百毫秒，确保在下一个事件的反应开始之前，前一个事件引起的脑反应已经消退。（刺激的取消也会产生脑电波扰动）

原因：

时间-频率分解引入了一定的时间平滑；

时间-频率响应可能会在实验事件结束后持续数百毫秒。

对于某些类型的实验来说，这可能很难实现，例如，如果按钮按下紧随刺激之后，或者如果需要将刺激紧密地排列在时间上，例如注意力闪烁任务中。

如果对刺激的电生理反应的大致持续时间尚不清楚，可以使用长时间的事件间隔来引导任务，看看对每个事件的电生理反应持续多久。

Intertrial Timing :

对于intertrial interval（试验间间隔），

考虑将用于任务相关数据的基线归一化的时间段以及要分析的频率。

时间-频率分解的基线时间段应该在试次开始之前结束，例如-500至-200毫秒。

原因：时间滤波可能导致一些早期的刺激后活动“泄漏”到刺激前的基线期，而这种时间泄漏在较低频率下可能更严重。

这与ERP不同，因为ERP的基线期通常在time = 0的事件结束时结束。

intertrial interval可以固定或变化。

固定：被试能够预测即将开始的试次的时间，他们可以为试次做准备。

变化：被试可能会试图猜测下一个试次的开始时间，这可能引入时间的期望、意外和不确定的任务准备。这些过程可能会随着试次间隔的持续时间而以非线性的方式变化（e.g.，作为hazard function）。

被试几乎总是会产生关于下一个试次何时出现的时间期望，而这些期望很可能会影响脑电图和行为。

6.4 How Many Trials You Will Need 多少次试验

取决于数据的信噪比特征、试验影响大小、将执行的分析类型。

于许多分析来说，每个被试条件至少50个试次；

有些成分具有统计上的稳健性可以更少。

6.5 How Many Electrodes You Will Need 多少电极

取决于你计划执行的分析，以及你计划绘制的推论。

例：

脑源重建分析并推断大脑定位，更多的电极（>100）有助于提高空间滤波器的信噪比和准确性。

测量P3振幅，技术上只需要三个电极（一个放置在中央顶叶皮层上记录P3，一个作为参考，一个用于地面）。

使用64个电极将允许您应用空间过滤器，执行连接性分析，并检查结果的地形分布，应该足以用于几乎所有的分析，而不会显著增加数据分析的时间或硬盘数据存储。

更多电极会增加准备时间（打导电膏之类的）和电脑存储计算压力。

6.6 Which Sampling Rate to Use When Recording Data 怎么设置采样率

取决于计划进行的分析类型、计划分析的频率以及可用的磁盘空间和处理器速度/类型。

决定数据的时间分辨率。

至少两倍于感兴趣的最高频率进行采样（Nyquist定理）

实践中，应该对最高频率的两倍以上进行采样。

每个振荡周期内具有更多的数据点可以增加信噪比。

特别是如果你的分析涉及使用相位角时间序列，因为相位角时间序列相比功率时间序列更容易丢失时间信息。

采样率存在上限，超过该上限无法获得更多附加信息。

例如，以20,000赫兹的采样率来采集脑电数据，不太可能提供比以1,000赫兹采样的数据更多的信息。

在实践中，采样率在500赫兹到2,000赫兹之间可能足够满足所有分析需求。

超过2,000赫兹的采样率只在某些需要精确测量大幅度伪迹的情况下才有用，例如同时进行EEG和fMRI记录。

（本书提供的数据最初以2,048赫兹的采样率记录，经过下采样至256赫兹以减少下载和分析时间。）

最好是高采样率记录数据，必要时降采样。

6.7 Other Optional Equipment to Consider

可以与脑电图设置集成的可能附加组件

Response EMG or force grips 肌电图/力度抓握

Eye tracker 眼动仪

Electrode localization equipment 电极定位设备（常见于MEG，EEG主要依赖电极位置的标准模板）