【matlab】spm数据处理

推荐b站：BV1D54y1Y7Ca/ BV1bC4y1H7ux

1. dicom转换：mriconvert MRIcro SPM

2. 数据来源：https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/data/face_rep/（351个功能项和1个结构项）
   扫描参数：volume：646424 TE=40ms TR=2s（剔除前五个时间点）

3. 打开spm，可以先点击display查看图像
   
   

4. 发现图片有一些重影，可以点击SPM Figure->Colous->Effects->Brighten 让图片变得亮一些…


Est&Res：既评估头动状况，还根据头动状况重写数据

5. 点击Data，创建new session
   
   

6. session->specify->选择数据->select all->Done，然后就能看到session后面变成351
   

7. 保存设置
   

8. run一下
   
   看到原来文件中
   

9. 时间层矫正slice timing
   

10. 配置参数，number of slices=24，TR=2，TA=（扫描第一张到最后一张slice的起始时间差）2-2/24 TR-TR/slices，slice order（slice的采集顺序）=24：-1：1（即24->23->22->21…1）冒号用英文，reference slice以中间为参考=12，写完保存
    
    
    

11. 配准 中间少了一步配reference image的，就是选择平均，正则为^mean，选择那个文件就行，配source image，其他参数默认，保存，运行
    
    

12. segement分割（分成灰质白质和脑积液），volume->save bias corrected生成偏差校准后的结构项文件，deformation fields->forward，保存，运行
    
    
    

13. 标准化，选write->deformation field->image to write,保存运行
    
    
    

14. 如果想将被试的功能项激活，叠加到自己的结构项上，还需再一次normalise，第一步（deformation）同上，第二步结构项->m开头文件，保存运行
    
    

15. 平滑,选以war开头的文件，保存运行
    

16. 批处理
    
    
    
    通过点击spm下面的选项，然后配置参数，完成批处理