24小时完成1074个氨基酸分子动力学模拟，北鲲云超算平台为北京高校药学院科研攻关提供强力支撑

有限的超算中心和自建计算集群的方式已无法满足超算用户计算业务和创新的需要，无需排队的、独享式的云端高性能计算集群越来越受中国乃至全球科研人员的青睐，成为科研创新的一大推动力。

北京某高校药学院药物化学课题组需要研究和测定氨基酸类药物在人体中的扩散系数及热力学性质。

氨基酸在医药上主要用来制备复方氨基酸输液，也用作治疗药物和用于合成多肽药物。不论是使用过程还是生产过程，都涉及药物水溶液的扩散及相关一些热力学性质的数据。

课题组本地拥有2台GeForce GTX 1080和1台NeXtScalenx360 M5。随着研究课题的深入，模型分子越来越大，这也意味着数据分析和科学超算工作也将成倍增加,本地服务器已无法满足当前科研算力需求。课题组还咨询了本校超算中心，但需要等待半个月才有计算资源。为了不耽误研究进度，团队对市面上多家公有云及云超算平台进行测试。综合效率、成本、易用性和服务等多种因素，最终选择了北鲲云一站式云超算平台。

课题组在北鲲云超算平台启动1张单卡Nvidia V100使用Amber软件采用分子动力学手段模拟了1074个氨基酸,共78102个原子在水中的扩散性质，模拟时长5ns，仅需24小时。

据悉，在相同体系下，使用本地1张GeForce GTX 1080 GPU卡进行模拟，需要64个小时。

北鲲云配有独有的并行计算调度管理模块，可在短短几分钟内快速构建与安装部署一个“独享式”的云端高性能计算集群。

课题组负责人表示，“这个“独享式”的集群，拥有丰富的CPU和GPU资源、300多个计算软件及近百个生命科学数据集，能够为科学研究提供稳定高效的算力支持和全流程业务服务，从而降低创新药物前期研发的成本与周期。”

药物攸关国家安全,关乎人民健康，北鲲云也将持续发挥科技优势，依托于强大的云端高性能计算技术，助力科研机构的研发工作提速，为新药研发提供强大的技术后盾。