QTL定位（作物）

1.原理

分析分子标记与目标性状QTL之间的连锁关系 。 即利用已知座位的分子标记来定位未知座位的数量性状，通过计算分子标记与QTL之 间的交换率，来确定QTL的具体位置 。

常见的分子标记

应用最广泛、分子标记连锁图谱密度最大的分子标记：RFLP（限制性内切酶片段长度多态性）

实验操作简单、方便 、快捷 、标记多态性高且适应大批量应用：SSR（简单重复序列）

最有发展前景（目前使用最多）：SNP（单核苷酸多态性）

2.QTL定位的前提条件

2.1性状选择

双亲目标性状差别较大

在后代中分离明显，表型性状容易分组

双亲亲缘关系较远，具有足够多的多态性分子标记

2.2具有前人已经构建好的分子标记遗传图谱

3.QTL定位相关的遗传群体

简单来说，初级作图群体容易构建，但是QTL的定位并不会很精确；高级作图群体工作量大，QTL则相对准确。

4.QTL定位分析方法

4.1零区间作图法 the single maker mapping

仅利用单一的分子标记即可作图，且不需要完整的分子标记图谱；

存在的主要问题在于检测到的QTL 通常不会正好落在标记所在的座位上 ， 从而导致对该QTL位置和效应估计的偏差。

4.2单区间作图法 the interval mapping 

又称双标记QTL定位法，利用QT