Moltemplate建模----水盒子data文件

1

功能介绍

    Moltemplate是LAMMPS官方支持的建模工具之一，适用于LAMMPS建模。该程序创建了一种简单的文件格式来存储分子定义和力场，即模板LT。LT文件包含与特定分子有关的所有文本（包括坐标，键拓扑，角度，力场参数，约束，组和修复）。

    Moltemplate可以复制分子，对其进行自定义，然后用它作为构建更大、更复杂分子的基础。构建后，可以自定义单个分子和亚基（原子和键，以及可以插入、移动、删除和/或替换子单元）。Moltemplate支持所有LAMMPS力场样式以及几乎所有原子样式。

    Moltemplate被设计用于粗粒化模拟。要实现全原子模拟，可以使用ATB服务（https://atb.uq.edu.au）下载适应于目标分子的LT文件，或手动创建LT文件。

2

水盒子构建

    构建水分子盒子，我们需要准备单个水分子的IT文件，来储存水分子对应的力场和结构信息，然后就需要确定对应的水盒子大小以及单个水分子沿三个方向复制平移的距离。

    在本示例中&