科研绘图系列:R语言绘制基因组突变和拷贝数变异瀑布图(oncoPrint)

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介绍

maftools的瀑布图(Oncoplot),也称为水落图,是一种在癌症基因组学研究中常用的可视化工具,用于展示队列中突变的全景。以下是对maftools瀑布图的说明和解读方法:

说明

  1. 基因与样本表示
    • 瀑布图由一个主矩阵构成,其中每一行代表一个基因,每一列代表一个样本。
    • 矩阵被组织和排序,以在顶部显示频繁突变的基因。
  2. 突变展示
    • 图中的每个点代表一个突变,点的位置对应于特定基因和样本的交点。
    • 突变通常以不同颜色表示,以展示不同的突变类型或状态。
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