报名倒计时7天丨MindSpore SPONGE暑期学校，昇思“圳”等你来！

由昇思MindSpore开源社区联合北京大学化学与分子工程学院、昌平实验室、深圳湾实验室举办的第四季「MindSpore SPONGE暑期学校」正在火热招生中，目前已收到了来自国内多个知名高校、科研机构、企业等开发者的踊跃报名。

本期暑期学校主题为【分子动力学模拟方法与实践--人工智能与增强采样】，旨在为对分子动力学模拟感兴趣的同学提供相关资源，为分子动力学模拟的学习打下基础，带领大家从理论到实践，并探索AI与分子动力学模拟结合的多种应用场景。

往期风采

MindSpore SPONGE暑期学校已成功举办三期，来自北京大学、中国科学技术大学、昌平实验室、深圳湾实验室等高校和科研机构老师为学员授课，暑校为学子搭建了一个与AI+分子模拟领域专家面对面交流学习的平台，并通过上机实践体验MindSpore SPONGE在分子模拟中的使用，助力学生开发者成长。

暑期学校累计收到了来自北京大学、清华大学、浙江大学、中国科学技术大学、上海交通大学、香港科技大学等超50所高校上千名学生的踊跃报名，线上直播也高达3w+人观看

基于MindSpore SPONGE的最新科研进展

01、昇思MindSpore联合高毅勤团队在JCTC发表的综述文章荣获编辑良择：人工智能增强的分子模拟

当前主流的分子模拟软件往往诞生于几十年前，在很多地方都难以适应当今IT技术的发展，AI 算法难以集成在分子模拟软件中。高毅勤教授与杨奕研究员团队联合华为团队提出了一种“类AI”的分子动力学模拟程序架构，并基于华为开源的全场景 AI 框架昇思MindSpore 开发了 AI 原生分子模拟程序 MindSPONGE，可以如执行 AI 训练那样运行MD模拟程序。

人工智能增强的分子模拟，图片来源于ACS美国化学会
在该架构下，MD 模拟被看作一种特殊的 AI 训练过程，原子坐标相当于神经网络参数，势能函数相当于作为优化目标的损失函数，而 MD 积分器则相当于一种特殊的AI优化器。根据这种相似性逻辑，分子模拟程序可以自然而然地在AI框架中重构。该框架可以充分发挥昇思 MindSpore 作为 AI 框架的强大能力，提供了可微编程、高通量计算和自动硬件迁移等非常有吸引力的功能。

02、基于昇思MindSpore的抗体设计天工大模型荣获“2023AIIA 人工智能十大先锋应用案例”

传统的抗体设计方法效率低、实验成本高，基于人工智能的抗体设计方法，能够针对快速变异的病毒高效改造抗体。昌平实验室和协和医学院开发了基于昇思MindSpore的抗体设计模型“天工”，通过多段功能区域的联合分布改造生成抗体序列，能够实现抗体功能设计、序列嫁接和活性预测等多种任务。

“天工”模型设计效率相比传统抗体设计方法提升一个数量级以上，有效缩短了抗体药物研发周期。基于“天工”模型嫁接改造得到的人源抗体，经协和医学院团队实验验证抗体表达量提升约5至10倍，有望将抗体生产成本降低2倍以上。

03、携手昇思MindSpore，中科大刘海燕团队、元构生物共同研发蛋白质结构预测与设计模型PVQD

中国科学技术大学刘海燕教授团队、安徽元构生物科技有限公司与昇思团队联合推出了基于昇思MindSpore AI框架打造的蛋白质结构预测与设计模型PVQD。该模型通过一维向量序列的离散隐空间编码，用统一的扩散生成模型实现单序列预测动态构象分布、构象柔性等能力。

如图所示，与此前设计方法相比较，PVQD能够生成β结构及长环区含量更接近天然蛋白的结构，这样的结构柔性更高，可以承载更丰富的构象动力学。这种主链构象柔性与构象动力学对实现重要的蛋白质功能（如酶催化和变构调控）至关重要。PVQD模型融合AI+生物计算技术，在蛋白质结构预测领域实现突破性创新，在药物靶点发现上具有重要价值，将为生物制药产业带来全新研发动力。