【无标题】Ubuntu18.04上安装FSL，运行fsl函数时报错

已于 2022-08-14 21:56:44 修改
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于 2022-08-14 21:46:06 首次发布
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在VMware虚拟机安装了Ubuntu18.04,然后在Ubuntu上安装FSL，用脚本的方式安装的

1、sudo python2  fslinstall.py,这条命令运行顺利，stage1 和stage2都顺利完成。

2、输入FSL也能打开GUI，输入fsleyes也能打开界面

3、调用函数（fslmaths、flirt等），就不能运行，显示如下图内容b4071ec4328b4a338f271089597b3294.jpg

 想请教一下大家，是什么原因，怎么解决呢？

 

 

LZJ2282677129
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### 回答1： 以下是在Ubuntu 18.04上安装FSL 6.05的步骤： 1. 打开终端并输入以下命令以更新软件包列表： sudo apt-get update 2. 安装FSL依赖项： sudo apt-get install libxp6 libxp-dev libxmu6 libxmu-dev libxpm4 libxpm-dev libxt6 libxt-dev libxaw7 libxaw7-dev tcsh 3. 下载FSL 6.05安装包： wget https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsldownloads/fslinstaller.py 4. 运行安装程序： python fslinstaller.py 5. 按照提示进行安装。在安装过程中，您将需要提供管理员密码和FSL许可证。 6. 安装完成后，您可以在终端中输入以下命令以启动FSL： source /usr/local/fsl/etc/fslconf/fsl.sh 7. 您还可以将此命令添加到您的.bashrc文件中，以便每次启动终端时自动启动FSL： echo "source /usr/local/fsl/etc/fslconf/fsl.sh" >> ~/.bashrc 8. 现在，您已经成功安装了FSL 6.05，可以开始使用它来进行神经影像分析。 ### 回答2： FSL（FMRIB Software Library）是一款用于功能性磁共振成像（fMRI）和磁共振成像（MRI）数据处理的软件套件。本文将介绍如何在Ubuntu 18.04上安装FSL 6.05。 步骤一：下载FSL安装文件 首先需要从FSL的官网下载安装文件（https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsldownloads_registration）。 下载完毕后，将安装文件解压缩。 步骤二：添加FSL的环境变量 使用文本编辑器打开用户根目录下的.bashrc文件，添加以下内容： ``` # FSL setup FSLDIR=/path/to/fsl/fsl-6.05 PATH=${FSLDIR}/bin:${PATH} export FSLDIR PATH . ${FSLDIR}/etc/fslconf/fsl.sh ``` 将上面代码中的/path/to/fsl/fsl-6.05，替换为实际的FSL安装目录。 保存文件后，执行以下命令使设置生效： source ~/.bashrc 步骤三：测试安装 在终端中输入fsl，如果能够显示版本及其他信息，则安装成功。 步骤四：使用FSL FSL有很多功能强大的工具，可以通过FSL的官方网站或官方手册学习和使用。本文只是简单介绍如何安装FSL，在使用FSL之前，可以参考FSL官方指南。 总结 以上就是在Ubuntu 18.04上安装FSL 6.05的步骤。FSL是一款非常强大的MRI处理套件，安装成功后可以使用其众多工具进行MRI数据分析，可以帮助医学研究人员更加深入地研究脑部结构和功能。 ### 回答3： 在Ubuntu 18.04上安装fsl6.05需要按照以下步骤进行操作： 1. 首先，需要从官方网站下载fsl6.05软件包。可以访问FSL官网下载页面，选择最新版本的FSL安装包并下载。 2. 下载完成后，将FSL安装包解压到指定目录。可以使用bash终端打开安装包所在的文件夹，然后使用以下命令进行解压： tar -zxvf fslinstaller.tar.gz 3. 解压完毕后，需要运行FSL安装程序进行安装。可以在bash终端中进入解压后的FSL文件夹，并使用以下命令启动安装程序： ./fslinstaller 4. 在安装程序界面中，按照提示进行选项设置和确认。需要注意的是，安装时需要选择安装路径，一般推荐选择默认路径。 5. 安装程序运行到结束后，需要设置用户环境变量使系统可以正确使用FSL。可以在用户的bash配置文件（例如~/.bashrc）中添加以下内容： FSLDIR=/usr/local/fsl PATH=${FSLDIR}/bin:${PATH} export FSLDIR PATH 6. 添加完毕后，保存配置文件并重启bash终端。输入以下命令进行FSL版本验证： fslinfo 如果成功安装，会输出当前的FSL版本号。 总的来说，安装FSL6.05在Ubuntu 18.04上并不是非常困难。按照以上步骤进行操作，可以顺利完成安装并使用FSL进行神经科学数据处理和分析。

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