Ubuntu 18.04下安装FSL的一些说明

因为做项目要用到fsl,于是就屁颠屁颠跑去官网下,发现下载不下来,就去翻各种文档,走前人走过的坑~
亲身试验过的方法如下:
参考博客1:https://blog.csdn.net/sinat_35907936/article/details/112969857
博客也提供了两个版本的fsl下载,但是会缺少fsleyes,经过我后面需要用到eddy tbss等工具,发现fsl错误提示:一些文件找不到,所以有相同问题的小伙伴用下面网盘进行下载相关缺失文档的下载,如果发现里面没有所需要的文档或者链接不存在等情况,请留言联系。
链接: https://pan.baidu.com/s/1UZpDs7iUPs1nWHv5sWO6Og?pwd=wepz 提取码: wepz
–来自百度网盘超级会员v5的分享

参考博客2:https://blog.csdn.net/qq_35911756/article/details/105362447
这篇博客说要搭梯子就可以下载。
首先需要确认ubuntu上有python2.x (Ubuntu默认不带python2.x, 所以需要进行安装),命令:sudo apt install python 安装完成后查看所安装的Python:cd /usr/bin/这个命令,然后终端敲python,不要按回车,按两下Tab键即可显示出所安装的Python,下图是我Ubuntu中的Python:

在这里插入图片描述

然后在终端进行Python版本测试,测试方法:输入Python,如果终端提示为python2.x那么就直接用python fslinstaller.py即可,下图是我进行的测试:
在这里插入图片描述
我显示的是python3.8,所以不能直接用上面的命令,因为存在python2.7,所以终端输入python2.7进行测试:
在这里插入图片描述
所以我安装fsl的命令就变成了:python2.7 fslinstaller.py ,就可以直接用官方进行安装,直接一气呵成(就是时间有点长)。

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### 回答1: 以下是在Ubuntu 18.04安装FSL 6.05的步骤: 1. 打开终端并输入以下命令以更新软件包列表: sudo apt-get update 2. 安装FSL依赖项: sudo apt-get install libxp6 libxp-dev libxmu6 libxmu-dev libxpm4 libxpm-dev libxt6 libxt-dev libxaw7 libxaw7-dev tcsh 3. 下载FSL 6.05安装包: wget https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsldownloads/fslinstaller.py 4. 运行安装程序: python fslinstaller.py 5. 按照提示进行安装。在安装过程中,您将需要提供管理员密码和FSL许可证。 6. 安装完成后,您可以在终端中输入以下命令以启动FSL: source /usr/local/fsl/etc/fslconf/fsl.sh 7. 您还可以将此命令添加到您的.bashrc文件中,以便每次启动终端时自动启动FSL: echo "source /usr/local/fsl/etc/fslconf/fsl.sh" >> ~/.bashrc 8. 现在,您已经成功安装FSL 6.05,可以开始使用它来进行神经影像分析。 ### 回答2: FSL(FMRIB Software Library)是一款用于功能性磁共振成像(fMRI)和磁共振成像(MRI)数据处理的软件套件。本文将介绍如何在Ubuntu 18.04安装FSL 6.05。 步骤一:下载FSL安装文件 首先需要从FSL的官网下载安装文件(https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsldownloads_registration)。 下载完毕后,将安装文件解压缩。 步骤二:添加FSL的环境变量 使用文本编辑器打开用户根目录下的.bashrc文件,添加以下内容: ``` # FSL setup FSLDIR=/path/to/fsl/fsl-6.05 PATH=${FSLDIR}/bin:${PATH} export FSLDIR PATH . ${FSLDIR}/etc/fslconf/fsl.sh ``` 将上面代码中的/path/to/fsl/fsl-6.05,替换为实际的FSL安装目录。 保存文件后,执行以下命令使设置生效: source ~/.bashrc 步骤三:测试安装 在终端中输入fsl,如果能够显示版本及其他信息,则安装成功。 步骤四:使用FSL FSL有很多功能强大的工具,可以通过FSL的官方网站或官方手册学习和使用。本文只是简单介绍如何安装FSL,在使用FSL之前,可以参考FSL官方指南。 总结 以上就是在Ubuntu 18.04安装FSL 6.05的步骤。FSL是一款非常强大的MRI处理套件,安装成功后可以使用其众多工具进行MRI数据分析,可以帮助医学研究人员更加深入地研究脑部结构和功能。 ### 回答3: 在Ubuntu 18.04安装fsl6.05需要按照以下步骤进行操作: 1. 首先,需要从官方网站下载fsl6.05软件包。可以访问FSL官网下载页面,选择最新版本的FSL安装包并下载。 2. 下载完成后,将FSL安装包解压到指定目录。可以使用bash终端打开安装包所在的文件夹,然后使用以下命令进行解压: tar -zxvf fslinstaller.tar.gz 3. 解压完毕后,需要运行FSL安装程序进行安装。可以在bash终端中进入解压后的FSL文件夹,并使用以下命令启动安装程序: ./fslinstaller 4. 在安装程序界面中,按照提示进行选项设置和确认。需要注意的是,安装时需要选择安装路径,一般推荐选择默认路径。 5. 安装程序运行到结束后,需要设置用户环境变量使系统可以正确使用FSL。可以在用户的bash配置文件(例如~/.bashrc)中添加以下内容: FSLDIR=/usr/local/fsl PATH=${FSLDIR}/bin:${PATH} export FSLDIR PATH 6. 添加完毕后,保存配置文件并重启bash终端。输入以下命令进行FSL版本验证: fslinfo 如果成功安装,会输出当前的FSL版本号。 总的来说,安装FSL6.05在Ubuntu 18.04上并不是非常困难。按照以上步骤进行操作,可以顺利完成安装并使用FSL进行神经科学数据处理和分析。

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