更多生信开发内容可查看本人专栏： 生信分析项目实战技能集合 1. 基于BAM文件性别判断原理 对于高通量测序数据，包括WGS和WES，根据bam文件里面的chrX和chrY的reas比例可以判断性别。如果chrX和chrY的reads比例超过一定阈值（例如100倍），则判定为女性，否则为男性。 2. 检测BAM文件chrX和chrY的reads数量 根据chrX / chrY染色体的reads比例，女性的Y/X染色体的reads比会显著大于男性。 # detect_gender.sh shell脚本 # 输入bam文件路径 bam_path=$1 # 输出包
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本文介绍了如何利用BAM文件中的chrX和chrY reads比例来判断样本性别，通过分析高通量测序数据，当Y/X reads比例超过特定阈值时，判定为女性，反之为男性。详细步骤包括检测reads数量和预测性别。
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