生信分析进阶15 - 从GTF文件提取起始密码子、终止密码子、外显子剪切供体和受体

从GTF文件提取起始密码子、终止密码子、外显子剪切供体和受体

1. 输入文件下载

在该页面可下载：https://download.csdn.net/download/LittleComputerRobot/90849018
以下三个文件：
ensemblv75_canonicalTranscriptIDs.lst.gz
ensemblv75_canonicalTranscriptIDs.protein_coding.lst.gz
Homo_sapiens.GRCh37.75.gtf.gz

# Homo_sapiens.GRCh37.75.gtf.gz也可以使用以下方法下载
wget ftp://ftp.ensembl.org/pub/release-75/gtf/homo_sapiens/Homo_sapiens.GRCh37.75.gtf.gz

转录本和基因等提取参考以下文章：