生信分析进阶7 - 人类CpG Islands数据bed文件下载

1. CpG Islands简介

CpG Islands（CpG岛）是指CG组合明显高于全基因组平均水平的DNA片段，通常靠近基因的转录起始位点，可以调节基因的转录活性。在哺乳动物中，CG碱基对组合很少见，因为CG碱基对中C碱基-胞嘧啶容易被甲基化，而甲基化后的胞嘧啶由于脱氨作用会转变为碱基T-胸腺嘧啶，因此CG有转换为TG的倾向，只有某些特殊原有，CG组合才能保留。

2. CpG Islands数据文件下载

进入UCSC主页，点击Tools > Table Brower > 填写以下信息 > Get output > get BED ，会下载得到一个bed文件（文件名称可以自定义）， 以Human为例，填写信息如下：

UCSC主页地址： https://genome.ucsc.edu/index.html

物种 genome: Human
基因组版本 Assembly: Feb, 2009 (GRCh37/hg19)
组 group: Regulation