生信分析进阶10 - 定相基因型数据中的血统同一性（IBD）片段和血统纯合性（HBD）片段检测

1. 检测定相基因型数据中的血统同一性（IBD）片段和血统纯合性（HBD）片段

hap-ibd程序检测定相基因型数据中的血统同一性（IBD）片段和血统纯合性（HBD）片段，支持分析数十万个样本的数据集。

论文:

Y Zhou, S R Browning, B L Browning. A fast and simple method for detecting identity by descent segments in large-scale data. The American Journal of Human Genetics 106(4):426-437. doi: https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2020.02.010

2. 安装

hap-ibd程序需要Java版本1.8（或更高版本）。使用早期的Java版本将产生“不支持的类版本”错误。

wget https://faculty.washington.edu/browning/hap-ibd.j