R语言用igraph绘制网络图可视化

最新推荐文章于 2024-09-06 13:50:20 发布

Mrrunsen

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分类专栏： R语言大学作业文章标签： r语言开发语言

本文链接：https://blog.csdn.net/Mrrunsen/article/details/122636255

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本文探讨了如何利用R语言中的igraph库进行网络图的深度定制，包括自定义节点属性、设置节点标签特征以及调整边的样式。通过实例展示了如何结合使用这些功能来创建复杂的网络可视化效果。

摘要由CSDN通过智能技术生成

这篇文章假定你已经知道如何用igraph库建立一个基本的网络图。

基本上，igraph允许将几种类型的输入转化为一个图形对象，可以使用plot()函数绘制，如下所示。

# 创建数据
network <- graph(data , mode='undirected')

# 默认网络

plot(network)

自定义节点功能

节点可以修改几个参数，这些参数都以顶点开始。顶点是igraph语言中的一个节点。主要选项在下面的代码中解释。

    vertex.frame.color = "green",            # 节点边界颜色
    vertex.shape=c("circle","square"),             # "none", "circle", "square", "

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利用igraph包绘制网络图（R语言）

DevGOOD的博客

08-28

863

在R语言中，可以使用igraph包来创建和绘制网络图。本文将详细介绍如何使用igraph包在R语言中创建和定制网络图，并提供相应的源代码示例。你可以根据自己的数据和需求，定制网络图的各个方面，以便更好地理解和展示复杂关系。运行上述代码将生成一个简单的网络图，其中节点用圆圈表示，边用线段表示。节点和边的颜色、大小以及节点的布局位置都可以根据需要进行定制。igraph包提供了多种布局算法，用于确定节点在可视化图中的位置。以上代码将根据指定的布局算法绘制网络图，并应用之前设置的节点和边的颜色、大小。

利用igraph包绘制网络图

Mrrunsen的博客

03-02

1766

本文是复杂网络课的一个小作业，主要学习如何导入图数据以及如何利用igraph包绘制网络图。导入边数据和节点数据这里主要是将边数据和节点数据分别导入，再利用igraph包中的graph_from_data_frame()将边，节点数据进行合并构成一个网络图。注意：节点数据中可包含一些属性（年龄，性别等），这些属性可以再在分析和绘图中起到较大作用。比如：各个节点的形状可由年龄大小决定，节点颜色可由性别决定。在我们本文的数据中，只包含一个节点属性（课程所含类别：1，2，3，4），数据包含36个节点，3

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R语言使用igraph包绘制网络图

CinboWang的博客

12-17

5344

效果如下 library(igraph) # Create data set.seed(1) data <- matrix(sample(0:1, 100, replace=TRUE, prob=c(0.8,0.2)), nc=10) network <- graph_from_adjacency_matrix(data , mode='undirected', diag=F ) # Default network par(mar=c(0,0,0,0)) opar <- par(no

frame越过另一个frame_R语言做网络图的又一个小例子

weixin_39627390的博客

11-26

142

使用R语言包ggraph做网络图需要准备的最基本的数据是：1、一个包括一列数据的数据框，每一行是各个节点的名称2、一个包含两列数据的数据框，每一行代表节点节点之间的连线比如一个有四个节点的网络，每个节点是A,B,C,D。两两节点互相连接。数据的样子：> nodes<-data.frame(node=c("A","B","C","D")) > edges<-data.fram...

使用Python中的igraph为绘图添加标题和图例

weixin_44617651的博客

09-06

1103

在 igraph 中，可以通过添加标题和图例来增强图形的可读性和表达能力。我们可以使用 igraph.plot 函数进行绘图，并通过它的参数来指定标题和图例。

R语言绘制著名的网络连通图

临风暖阳的博客

08-03

551

笔者主要用R语言绘制著名的网络图，供大家参考

用 R 绘制交互式社会网络图

2301_79326891的博客

08-27

329

本文介绍了如何使用 R 语言中的igraphnetworkD3和visNetwork包来绘制和呈现交互式社会网络图。通过准备节点和边的数据，然后使用适当的函数和参数，我们可以创建出具有交互性的社会网络图。在使用igraph包时，我们可以通过转换图形对象并使用visNetwork包来实现交互性。而使用networkD3包时，可以直接使用函数创建交互式的社会网络图。# 安装所需包# 加载包# 创建节点数据框# 创建边数据框# 使用 igraph 创建静态社会网络图。

使用igraph库在R语言中绘制网络图可视化

TechSavant的博客

08-27

652

在上面的代码中，我们首先创建了一个包含5个节点的向量nodes，然后创建了一个包含4条边的向量edges。最后，我们使用graph()函数创建了一个网络图对象graph，其中edges参数指定了边的连接关系，n参数指定了节点的数量，vertices参数指定了节点的标签，directed参数设置为FALSE表示创建的是无向图。我们将从安装igraph库开始，然后演示如何创建网络图对象、设置节点和边的属性，并最终绘制出具有自定义样式的网络图。shape表示设置节点的形状，$size表示设置节点的大小。

使用R语言igraph和ggraph包绘制基因相互作用网络图

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池塘春草梦的博客

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06-20

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1.什么是相互作用网络图？生物网络是复杂网络，也是以系统科学的思想研究生命科学的桥梁。网络中的节点可以是蛋白质，基因，RNA或DNA等，网络的边对应节点之间的物理、生化或功能上的相互作用。生物分子之间的相互作用并不是一成不变的，反应在基因调控网络上，则节点之间的边会因时间、空间或外部环境的变化而发生变化。网络比较和分析是生物网络的研究重点。网络中生物分子及其相互作用的显著变化，形成差异性网络，这种差异性变化对细胞信号传导、细胞发育、环境压力、药物治疗以及疾病状态的转变具有重大的参考价值。 网络图主要由边和

Igraph包绘制network

weifanbio的博客

05-21

1619

以下是Igraph包绘制网络图的小例子。 1.基础网络图绘制； library(igraph) # 创建数据框 links=data.frame( source=c("A","A", "A", "A", "A","J", "B", "B", "C", "C", "D","I"), target=c("B","B", "C", "D", "J","A","E", "F", "G", "H", "I","I") ) # 将数据框转变为igraph可用的对象 network &lt

用R在地图上绘制网络图的三种方法

悟道西方

07-08

1128

地理网络图与不同，当引用地理位置进行节点时，需要将这些节点放置在地图上，然后绘制他们之间的连结。的帖子(https://datascience.blog.wzb.eu/2018/05/31/three-ways-of-visualizing-a-graph-on-a-map/)，非常赞。其中他的部分思路对于我们很有帮助。首先准备需要的R包，当需要一次性加载多个R包时，我们可以利用pacman，它整合了library包中的一些相关函数，利用pacman包中的p_load。

R语言生信图表学习之网络图

Mrrunsen的博客

07-21

1240

比如上面我造的数据中，nodes里面logrankP我想映射为点的大小，cluster是点的颜色，edges里面from和to两列是必须的，指定网络关系，correlation是映射为线的颜色，width是映射为线的粗细。这幅网络图主要就是点和线，其中点的颜色和大小都要设置不同的属性，线的颜色也要设置不同的属性，另外，这幅图中的点有2层，其中一层只有颜色的不同！画网络图时无非就是对点和线添加不同的属性，比如把某一个变量映射为点的大小，另一列映射为点的颜色，把某列映射为线条的粗细等。...

R 数据可视化 —— igraph 创建图

dxs18459111694的博客

11-21

2133

接下去的部分，我们要开始介绍层次关系与网络关系图片的绘制。层次关系型图标主要用于表达个体之间的层次关系，通常可以用来展示分类的多级关系，例如层次聚类的树状图、节点连接图、冰柱图、旭日图、圆填充图、矩形树状图等不同于层次关系结构，网络关系结构并不是自底向上或自顶向下的层次结构，展示了不同元素之间的更加自由和复杂的相互关系。如桑葚图、和弦图、弧长链接图、蜂箱图、边绑定图等。在图论中，图是由若干个节点或顶点（node或vertex）和连接两个节点的边（edge。

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09-29

1498

import igraph from igraph import Graph as ig import csv edges = [] firstLine = True # 读取文件 with open('storm_copy.csv', 'r') as df: for row in csv.reader(df.read().splitlines()): if firstLi...

【R语言实例】igraph — 网络分析与可视化包（1）

wong2016的博客

05-18

1万+

作者简介：本文作者系大学统计学专业教师，多年从事统计学的教学科研工作，在随机过程、统计推断、机器学习领域有深厚的理论积累与应用实践。 igraph是一套用于网络分析与可视化的r包，它以高效、便捷、使用简单的特点在网络分析研究中广泛采用。igraph可以在R环境下免费下载安装，目前也有Python实现的igraph. 本文将介绍如何使用igraph包进行基础的网络分析与可视化。 1. igraph 网络首先，清除R环境里的所有对象后，加载igraph包。 # Remove all the objects.