敏感性、特异度、α、β、阳性预测值（PPV）、阴性预测值(NPV)等指标及置信区间计算（附R语言代码）

最新推荐文章于 2024-06-13 16:15:47 发布
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分类专栏： R语言大学作业 文章标签： r语言 开发语言
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本文详细介绍了医学诊断中的敏感性、特异度、假阳性率（α）、假阴性率（β）、阳性预测值（PPV）和阴性预测值（NPV）等概念，并通过2×2混淆矩阵阐述其计算方式。此外，还讨论了敏感性和特异度之间的权衡，以及在不同患病率下PPV和NPV的变化。文章提供了R语言代码帮助理解并计算这些指标。
摘要由CSDN通过智能技术生成

这个虽然简单但老是被绕进去，所以整理一下方便查阅。

首先画一个2×2的混淆矩阵confusion matrix：

在这里插入图片描述

TP = True positive（真阳性）

FP = False positive （假阳性）

FN = False negative（假阴性）

TN = True negative（真阴性）

敏感性（sensitivity）= 真阳性率 = 真阳/实际为阳 = TP/(TP+FN)

特异度（specificity）= 真阴性率 = 真阴/实际为阴 = TN/(TN+FP)

α = 假阳性率（误诊） = 假阳/实际为阴 = FP/(FP+TN) = 1-spe

β = 假阴性率（漏诊） = 假阴/实际为阳 = FN/(FN+TP) = 1-sen

约登指数（Youden index）=

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【R语言】敏感度、特异度、准确率检验及置信区间求解
Mrrunsen的博客
08-04 2475
在R语言中，进行敏感度、特异度、准确率检验以及计算置信区间是在医学诊断和分类问题中常见的任务。在本教程中，我将向您展示如何使用R语言进行这些检验和计算。以上就是使用R语言计算敏感度、特异度、准确率以及置信区间的基本步骤。这些指标和置信区间可以帮助我们评估分类模型的性能，并了解分类结果的可靠性。假设我们有一个二分类问题，其中0表示阴性类别，1表示阳性类别。在医学诊断和分类问题中，我们通常有一个分类结果和真实的类别标签。敏感度、特异度和准确率是评估分类模型性能的常见指标。敏感度、特异度、准确率的计算。
python基于机器学习三分类结果、计算三分类混淆矩阵、计算每一个类别对应的特异度（specificity）、灵敏度（sensitivity）、PPV、NPV
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[评估指标] 敏感性/特异性/PPV/NPV等指标原理与计算方法
chenyang2203的博客
05-06 6474
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（1）灵敏性，即病人中得出阳性检测的样本占病人总数的百分比； （2）特异性，即健康人中得出阴性检测的样本占健康人总数的百分比； （3）阳性预测值，即得出阳性检测的样本总数中，病人样本占阳性检测样本总数的百分比； （4）阴性预测值，即得出阴性检测的样本总数中，正常人样本占阴性检测样本总数的百分比。 ...
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sunflower_sara的机器学习园地
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机器学习中的准确率，敏感性，特异性，阳性预测值，阴性预测值，假阳率，假阴率 -九五小庞
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敏感性 特异性 阳性预测值 阴性预测值 Youden‘s index的python代码实现
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代码简洁无废话，一键复制很好用！
使用Python进行多个机器学习模型、多个评价指标表格绘制（AUC、敏感度、特异度、F1值、约登指数、MCC、Kappa等）
柳奈奈的博客
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本文简要介绍了常用的机器学习模型评价指标，并使用Python绘制单个模型和多个模型的各个评价指标的汇总表格。评价指标有：训练集AUC、测试集AUC、敏感度（Sensitivity）、特异度（Specificity）、PPV、NPV、PLR、NLR、F1值、Youden Index、MCC、Kappa。
混淆矩阵 灵敏度 特异度 阳性预测值 阴性预测值 阳性似然比 阴性似然比
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看过许多统计教程，这篇是我最推荐的 临床医生门诊接诊新病人时最常被问的估计是以下三个问题：我有病么？是什么病？怎么治啊？细细分析这三个问题，其中第一和第二个都是诊断问题，第三个是治疗问题。回想起多年前我临床实习的时候，带教老师说：疾病的诊断、鉴别诊断是关键，是治疗的基础。如何把有病的人和没病的人区分开，如何把患某种病的患者和其他...
灵敏度和特异度的置信区间怎么算？
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很多医学生及医生经常会对诊断实验进行评价，评价诊断试验的常用指标及计算方法都比较容易掌握，但是少有人知道其相应的95%的置信区间的计算方法。我们简单的回顾一下，诊断试验评价的基本方法是用所谓的“金标准”，确诊区分患者和非患者，再应用待评价的方法测定这些研究对象，然后比较两种方法的一致性。 预测值 阳性 阴性 实际值 患者 a b 非患者 c d 公式法 评价诊断试验的常用指标主要有灵敏度、特异度、一致率、Youden指数
怎么做蒙特卡洛计算npv_那些年被误用的PPV和NPV
weixin_32538033的博客
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前言谈起阳性预测值(PPV)，童鞋们可能还记得指的是“筛检试验检出的全部阳性例数中，真正患病的例数所占的比例”；而阴性预测值(NPV)则是指“筛检试验检出的全部阴性例数中，真正未患病的例数所占的比例”。如果将金标准诊断结果和拟评估的诊断方法诊断的结果列在四格表中，可以很简单地求出来PPV=a/(a+c)，NPV=d/(b+d)，正如本号之前发的文章诊断性试验评价指标汇总中提到的。但是，...
r语言敏感度、特异度、如何得到准确度,阳性预测值
12-21
R语言是一种流行的统计分析工具，可以用来计算敏感度（Sensitivity）和特异度（Specificity）。 敏感度指的是测试结果为阳性时，真正患病的人中有多少被正确识别出来的比例。特异度则是测试结果为阴性时，真正健康的人中有多少被正确识别出来的比例。在R语言中，可以使用混淆矩阵（Confusion Matrix）来计算敏感度和特异度。 一个简单的获取准确度的方法是使用混淆矩阵中对角线上的元素之和（即正确分类的样本数）除以总样本数。在R语言中可以使用以下代码来计算准确度： ```R # 创建一个简单的混淆矩阵 actual <- c(1, 0, 1, 0, 1) predicted <- c(1, 0, 0, 1, 1) conf_matrix <- table(actual, predicted) # 计算准确度 accuracy <- sum(diag(conf_matrix)) / sum(conf_matrix) ``` 阳性预测值（Positive Predictive Value）指的是当测试结果为阳性时，被识别为患病的人中有多少是真正患病的比例。在R语言中，可以根据混淆矩阵的元素计算阳性预测值。 总之，在使用R语言进行敏感度、特异度、准确度和阳性预测值的计算时，可以利用混淆矩阵和简单的数学运算来得到这些指标的值。同时，R语言也提供了丰富的统计分析函数和包，可以帮助用户进行更加复杂的统计分析和模型评估。
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