随着高通量测序以及生物信息学的发展,各物种基因组序列快速释放,为基因家族分析和论文写作带来了契机。基因家族的生物信息学分析也为后续基因功能研究提供了强有力的理论支撑,在数据挖掘中发挥着越来越重要的作用。更重要的是,快速、高效、高质量发表相关论文可以辅助科研工作者在晋升道路上提速。掌握基因组家族分析流程、提高学员数据分析技能、掌握基因家族SCI论文撰写思路和写作技巧,助力科研。
谢剑波(教授):重点高校及科研院所一线科研人员,长期从事生物数据分析与挖掘,基因测序等领域工作研究工作,以第一作者或通讯作者发表过多篇生物学一区、二区SCI高水平论文(如:Plant Cell、Plos genetics; New Phytologist; Journal of Experimental Botany等)。精通python语言等分析工具,具有丰富的科研及高通量测序数据分析与挖掘经验。
专题一 文献研读和方法解读 | 1.基因家族分析文献解读; 2.基因组学分析技巧; 3.生物信息大数据分析思路; |
专题二 基因家族注释文件解读 | 1.候选基因下载方式; 2.文件解读(基因组,GFF注释信息,蛋白信息,cds等); 3.Pfam保守结构域分析; 4.鉴定基因家族所有基因; |
专题三 基因家族生信分析 | 1.基因家族理论与分析技巧; 2.进化树(mega构建进化树,进化树的美化); 3.基因结构分析(外显子内含子,motif分析); 4.基因家族染色体定位; |
专题四 基因家族高级分析 | 1.基因组复制事件 (全基因组、串联重复等) 分析; 2.tbtools绘图基因复制事件; 3.KaKs分析; |
专题五 基因表达检测原理 | 1.基因表达量检测原理 2.热图绘制 3.表达趋势K means图聚类和分析 4.GO富集分析 5.KEGG富集分析 6.基因家族种间的共线性分析; 7.转录组数据分析基因家族的表达量和功能; 8.转录调控分析(miRNA和启动子顺势作用元件); 9.案例实操; 10.个性化分析方法总结; |
专题六 生信数据库专题 | 1.各种生信数据库的使用; 2.植物、动物、微生物基因组序列、转录本序列、蛋白序列下载方式; 3.启动子预测网站使用; 4.转录因子数据库使用; 5.MiRNA数据库使用; 6.MEME数据库注释保守结构域,启动子富集分析; 7.表达量测定。 |
专题七 高水平SCI论文分析撰写思路与绘图技巧 | 1.基因家族高级分析; 2.如何深度分析基因家族提升论文质量; 3.SCI论文整理技巧; 4.SCI论文绘图技巧; 5.韦恩图制作、峰图、箱线图、共线性图等制作技巧 |
专题八 总结 | 总结 |