基因集泛癌分析，强势来袭！！高分必选！！

本团队最近筛选到一些比较好的基因，需要对单基因泛癌做深入分析的请与本团队联系，先到先得。

1.快来看看7+的单基因-泛癌-纯生信怎么做，一看就会！

2.单基因泛癌发7+！可复现性极强！你值得拥有！

3.发篇单基因泛癌6+生信SCI有多难？边出图边写作，轻松搞定！

4.6+单基因泛癌纯生信，给你的科研加个buff！

5.燃！单基因8+发文新思路

6. 单基因干湿结合发4分SCI

7.单基因纯生信3.9分，两个月接收!

划重点：

对于基因集泛癌，难度系数比单基因泛癌高，需要技术和服务器支撑，最近也出来很多高分文章，分数可观，如下：

1. Comprehensive analyses of m6A regulators and interactive coding and non-coding RNAs across 32 cancer types. Mol. Cancer. 2021 April. (IF:27.401)

2. Pan cancer analyses reveal genomics and clinical characteristics of the melatonergic regulators in cancer. JOURNAL OF PINEAL RESEARCH. 2021 July. (IF:13.007)

3. Pan-cancer analyses reveal regulation and clinical outcome association of the shelterin complex in cancer. BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS. 2021 Sep. (IF:11.622)

4. The pan-cancer landscape of crosstalk between epithelial-mesenchymal transition and immune evasion relevant to prognosis and immunotherapy response. npj Precision Oncology. 2021 June. (IF:8.254)

5. Pan-cancer association of HLA gene expression with cancer prognosis and immunotherapy efficacy. BRITISH JOURNAL OF CANCER. 2021 Aug. (IF:7.64)

6. A pan-cancer analysis of the human tumor coagulome and its link to the tumor immune microenvironment. CANCER IMMUNOLOGY IMMUNOTHERAPY. 2021 April. (IF:6.968)

生信分析定制服务

请扫描下方二维码

您可以指定基因集的筛选条件，或者我们团队会帮您进一步筛选结果比较好的基因集推荐给您。接下来简单介绍一下我们团队基因集泛癌分析的一些内容。

1.对泛癌中所有的肿瘤进行差异分析，数据为TCGA+GTEx的结合，分析结果展示了通路中的基因在泛癌中的logFC和pvalue情况，红色为高表达，紫色为低表达，数值为基因对应的logFC。

2. 在泛癌中，我们对通路中的基因进行单因素回归分析，分析结果展示了基因集在泛癌中对预后的影响，红色代表通路的基因在肿瘤中是风险因素，而蓝色代表通路的基因在肿瘤中是保护因素。 

3.在泛癌中基因集基因之间的相关性，红色为正相关，蓝色为负相关。

4.在泛癌中通路中基因变异分析结果，包括扩增，缺失，突变等等变异情况。

5. 通路中的基因在泛癌中的基因突变情况，通路基因突变图谱，每一种肿瘤中基因突变差异的对比，图片左侧代表基因突变的比例，右侧代表突变的基因类型。

6.通路中的基因在泛癌中的ssGSEA通路评分

7.基因集评分与肿瘤分期的关系（包含不同肿瘤的分析结果）。

8.通路score与每种肿瘤患者预后的关系，包括泛癌中所有的癌肿分别与OS,PFI的关系。

9.通路中基因在每种肿瘤中与多种肿瘤经典通路评分的相关性分析。

10.使用通路score进行GSVA富集分析，展示该通路和哪些通路相关。下面展示的是GSVA富集分析的泛癌相关性分析结果。通路中的基因泛癌相关GSVA通路富集分析。蓝色部分代表基因高表达组富集通路，绿色部分代表基因低表达组富集通路。

11.estimate包评估肿瘤微环境的免疫分数和基质分数，并计算与通路score的相关性（与免疫评分强相关、基质评分、Estimate评分强相关）。

12.免疫浸润分析，通路score在泛癌中与免疫细胞浸润的相关性。

13.通路score与肿瘤突变负荷（TMB），微卫星不稳定性（MSI）的关系。

                  1.TMB         

2.MSI

13 通路score与免疫相关基因的关系，包括免疫检查点，免疫抑制基因，免疫激活基因，MHC基因，趋化因子和趋化因子受体等等。

该通路的基因与免疫检查点显著相关。 

您也可以指定特定的基因集，可以是一个通路、基因家族或者复合物等等，基因之间具有潜在的关联即可。您也可以指定基因集的筛选条件，或者我们团队会帮您进一步筛选结果比较好的基因集，如与免疫调节/耐药相关等等，适合发表文章以及后续课题申请。

生信分析定制服务

请扫描下方二维码

或添加微信沟通：ShengxinBoss1

往期回顾：

最强攻略1：史上最全单细胞数据库汇总解读

最强攻略2：史上最全非编码RNA数据库汇总解读

最强攻略3：史上最全外泌体数据库汇总解读

最强攻略4：史上最全甲基化表观调控数据库汇总解读

最强攻略5：史上最全转录调控数据库汇总解读

最强攻略6：史上最全网络药理学数据库汇总解读

点在看，SCI马上发表