18年NDVI斜率图生成

想自己用python实现多幅栅格图像多年变化率图的制作,但网上始终没有找到合适的代码。

基础太差了55555

贴老师写的多波段图像实现多年降水与气温的月NDVI相关系数图代码:

import numpy as np
from pyrsgis import raster
from scipy.stats.stats import pearsonr

RasterFile1 = 'D:/XXX/NDVIAPR.tif'
RasterFile2 = 'D:/XXX/tempAPR.tif'
ds1, tempArr1 = raster.read(RasterFile1)
ds2, tempArr2 = raster.read(RasterFile2)
nBands1, rows1, cols1 = ds1.RasterCount, ds1.RasterXSize, ds1.RasterYSize
features1 = np.empty((nBands1, cols1, rows1))
features2 = np.empty((nBands1, cols1, rows1))
features1[:, :, :] = tempArr1
features2[:, :, :] = tempArr2
features_result1 = np.empty((cols1, rows1))
features_result2 = np.empty((cols1, rows1))

for i in range(0, cols1):
    for j in range(0, rows1):
        list1 = []
        list2 = []
        for k in range(0, nBands1):
            list1.append(features1[k, i, j])
            list2.append(features2[k, i, j])
        r, p_value = pearsonr(list1, list2)
        features_result1[i, j] = r
        features_result2[i, j] = p_value
outFile1 = 'd:/TEMPcor4.tif'
outFile2 = 'd:/TEMPsig4.tif'
raster.export(features_result1, ds1, filename=outFile1, dtype='float', bands='all')
raster.export(features_result2, ds1, filename=outFile2, dtype='float', bands='all')

其中的np.empty我开始以为是np.zeros的用法,后来发现不是:

np.empty():它可以生成一个根据参数规定的数组;若不初始化则会生成随机数。

我觉得要改的话应该就是相同的思路:

第一个是用皮尔逊函数,求十八波段某月NDVI和十八波段某月降水/气温之间的相关性与显著性;

第二个可以看作是把NDVI-->年NDVI,pre\temp-->十八年这个时间序列。

目前为止我尝试过两种思路(对不起TAT是真的太菜了)

1.更改皮尔逊函数,找到可以是一个变量与常数18的线性回归函数(对不起对不起!我也不知道我怎么想的真的太蠢了!可能这就是没学概率论的下场吧。。缺乏常识)

2.更改参与计算的维度,即怎么表达十八年这个时间序列?

我尝试了修改features2[:, :, :] = tempArr1为features2[:,0,0] = tempArr2,list2.append(features2[k, i, j])修改为list2.append(features2[k, 0, 0])。

得到了如下结果(aa是错的,下面的是正确的)

接着去查如何正确用切片切出自己需要的维度:

a[:, :, :]表示,第一个冒号表示选择第几维,也就是第几个数组;第二个表示第几行;第三个表示第几列

详情可见:https://www.cnblogs.com/vincent-sh/p/12730509.html

于是将

features2[:, :, :] = tempArr1 --》 features2[0, :, :] = tempArr1 ,想表达只取第一个维度,也就是十八个波段的那一层;还是错误,得到的图像与上面那张相同

为什么操作不同,最后的结果还是一样呢???我太困惑了!!

分分钟破案:没有保存。。。打脸来得太快

#后来发现pycharm原来是不需要保存的哦!写一句存一句的那种

接着就报错了:ValueError: could not broadcast input array from shape (18,184,211) into shape (184,211)

查!“出现这个问题的主要原因是因为list中array的shape不一致造成的,所以发生这个问题的时候,条件允许的话先将list中数组的shape全部打印出来观察一下”(很明显当下不可以)

试了这篇博客https://blog.csdn.net/sinat_29957455/article/details/103487477的第二种用mask的方法,没有研究这个函数到底什么意思,这样

features1[:, :, :] = tempArr1 #三个纬度数组的全部内容

mask = np.zeros((18, 184, 211))
features2_mask = copy.deepcopy(mask)
features2_mask[:features2.shape[0], :features2.shape[1]] = features2
features1_mask = copy.deepcopy(mask)
features1_mask[:features1.shape[0], :features1.shape[1]] = features1

features2[0, :, :] = tempArr2

套了以后,报错:ValueError: could not broadcast input array from shape (18,184,211) into shape (184,211),跟上一个错误一模一样。

发现本身定义两个features的时候,就把人家维度定的是一样的,干嘛要再弄一次。。然后这样改了一波,

features2 = np.empty((nBands1))
features1[:, :, :] = tempArr1 #三个纬度数组的全部内容

mask = np.zeros((18,184,211))
features2_mask = copy.deepcopy(mask)
features2_mask[:features2.shape[0],:features2.shape[1]] = features2
features1_mask = copy.deepcopy(mask)
features1_mask[:features1.shape[0],:features1.shape[1]] = features1

features2[:] = tempArr2

报了个这个错误:

IndexError: tuple index out of range,超出数组范围。好吧,翻译了也看不懂,或许是mask里的参数设置错了呢?

学习mask:

即掩膜,很熟悉啊!

copy和deepcopy的区别:

看了https://blog.csdn.net/sinat_29957455/article/details/103487477后就觉得arcgis里的copy全是shallowcopy。

另外,docker又是什么鬼?

到这里忽然知道前面的为什么错了,每个像元不只是跟十八年的时间序列有关啊!它们也需要在纵横坐标上表达!那么问题出在哪里呢?

重新审视了这段代码,明白了是如何对两张图象中每个像元具有的值进行相关性分析的。于是有了一个奇奇怪怪的想法:能不能构建一个全部像元值相同,且随波段递增的十八波段图像呢?拿出了终极问题:如何arcgis中批量修改像元值?这什么鬼问题啊喂,怎么觉得似曾相识??

成功改变了一个shape file的属性值,那又如何?转成栅格了之后还是啥也没有了。。先睡一觉,明天一定可以的!

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看了一篇博客https://blog.csdn.net/weixin_39559804/article/details/110078530?ops_request_misc=%25257B%252522request%25255Fid%252522%25253A%252522160842401516780274069014%252522%25252C%252522scm%252522%25253A%25252220140713.130102334.pc%25255Fall.%252522%25257D&request_id=160842401516780274069014&biz_id=0&utm_medium=distribute.pc_search_result.none-task-blog-2~all~first_rank_v2~rank_v29-3-110078530.nonecase&utm_term=arcgis%E4%BF%AE%E6%94%B9%E5%83%8F%E5%85%83%E5%80%BCpython忽然想起栅格并没有属性表呀。。

然后明白了:

“1.多波段栅格是不会有属性表的。
2.单波段栅格,如果是浮点型,也不会有属性表。
3.单波段栅格,如果是整型栅格且没有属性表,可以通过ArcToolbox---数据管理工具---栅格---栅格属性---构建栅格属性表创建。”

好好地查着怎么批量修改属性表,怎么又走到clone这条山路TAT

查查查,栅格计算器好像还不错,http://blog.sina.com.cn/s/blog_627956c90101bfvl.html,过程中发现帮助文档很清楚地说有一个功能可以创建常量栅格!

https://blog.csdn.net/dsac1/article/details/37876381比较有逼格的博主,应该不会再错了吧!果然是见识短浅,很多个擦边球关键词都没有查到常量栅格这个东西,导致花费了更多时间去学了其他东西;也算不后悔吧!

想批量创建常量栅格、批量按掩膜提取的,奈何太菜,都是觉得自己写的是对的,结果又都运行不了。。。还试了C++的代码,运行不了是因为没有c++代码需要的库,于是乎喜提VScode赠送的vcpkg...当然这次都是没有用上的

老老实实创建了十八年的常量栅格,成功合成多波段图了以后,分析出来的值和老师的不一样!我真的不知道该怎么办了!55555TAT

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找到了一个提取NDVI的视频!完整回顾一下

处理过程:

辐射定标

掩膜

提取

计算植被覆盖度

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圣诞节去找了老师,值不同但长相相似的真相大白:

我的用了皮尔逊函数,所以是两个变量之间的相关关系;而变化趋势,指的是一个变量的变化情况,用的是它的斜率!所以这俩本质上是不同的。

相关性:其实可以从值看出来的

变化率:

只说图的话,看起来相关性对比比较强烈( ̄(工) ̄)

------------------------------------------关于anaconda的小(大)插曲----------------------------------------------------------

平安夜那天去找老师的时候,老师说anaconda3.8太新了,不够稳定,换成3.7的,结果这一换就是俩小时;我的电脑莫名其妙就不支持其中的一系列库,GDAL、numpy等等报错,遇到了老师也解决不了的问题。。回到寝室后自己慢慢琢磨,原来有安的库和anaconda版本始终不匹配的问题在里面,

ERROR: GDAL-3.1.4-cp39-cp39-win_amd64.whl is not a supported wheel on this platform.

ERROR: GDAL-3.1.4-cp37-cp37m-win_amd64.whl is not a supported wheel on this platform.
#总之就是因为不会看名字中的玄机,也不知道有命令可以读出电脑中的python对应支持的库的版本,就镇傻不拉几地一个一个试。。

cpXX里的XX表示的就是对应的python版本;而看自己电脑上的python支持的库的版本,(之前)可以使用

python -m pip debug --verbose

来查看自己电脑上的库的,但是之后突然就不行了TAT

然后又去查其他可以看支持包版本的命令,找到了一个用来更新pip的命令:

python -m pip install --upgrade pip

把电脑上的19.1.1---->20.3.3,再执行上一条就又可以看了!出来的结果长这样

回到圣诞节,老师给了生成斜率的函数,原来是他自己写的哦

import numpy as np

def trendline(data):
    order=1
    index=[i for i in range(1,len(data)+1)]
    coeffs = np.polyfit(index, list(data), order)
    slope = coeffs[-2]
    return float(slope)

调用就van事。不够之前有查到一个回归序列函数,叫lingress,改天试试吧;看来还是编程素养不行,自己编写函数的意识不够

结果出来和一开始那张图不一样???!!(得知真相后笑死)

怎么回事呢?哪个是正确的呢?前面那个错哪了呢?

老师坚持要查个水落石出!(步骤有点忘了。。或许每次请教老师的第一件事就是打开录屏)

先把出来的斜率栅格图转成点图层,这样每个栅格对应了一个点,图层就有了属性表;

然后提取一个点要素到一个新图层,把斜率图的十八波段数据多值提取到这个点里

把之前的多波段放进去,再把这个点的属性表导出到excel,转置后就有了十八年这个点的NDVI序列。(应该就是这样的吧?X)

但是我的arcgis的多值提取到点功能出毛病了。。。用地理处理里的提取出来出了第一年,十七年的栅格值全是一样的,试了几次才发现源数据就TM是错的,用了工具箱里的才成功了。

........记不得了,步骤过于混乱,到最后甚至不知道老师在点什么QAQ还手输每个像元值算斜率,结果出来比较大小过后最后才反应过来开始那张是2001-2019的,现在这张是2001-2018的图,当然不一样了。。。

不断地遇到问题,不断地解决,还是这样学得更快!虽然过程中挫败感无比强烈。

这是一篇写了一周的博客,甚至逻辑还很混乱,因为水平垃圾,犯错太多,记不得自己犯了哪些,也不是每一个都能找到或者学会并讲出解决方法。daydayup,加油哇

 

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