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PacBio
文章平均质量分 77
SHANGHAILINGEN
这个作者很懒,什么都没留下…
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Nat Biotechnol|MAS-Seq 方法学获生物科技领域权威期刊肯定
使用 PacBio Iso-Seq 测序方法可以捕获完整的转录亚型,但是因为通量有限,并没有被广泛应用,尤其是在单细胞转录组测序领域。短读长的RNA-seq已经被应用接近了20年,RNA-seq最常被用于分析基因的差异表达,从那时起它已经成为分子生物学中最常用的工具之一,极大的加速了我们对生物学的理解。利用T细胞分化过程中CD45的不同剪接模式,研究人员使用CITE-seq在蛋白质水平上对CD45亚型表达进行了正交验证,并将结果与使用MAS-ISO-seq检测的mRNA水平进行了比较。原创 2023-07-24 09:24:13 · 103 阅读 · 0 评论 -
凌恩生物资讯|宏基因组到底要不要去宿主?
评估去除宿主DNA的宏基因组测序对微生物组的有效性原创 2023-02-27 09:47:52 · 380 阅读 · 0 评论 -
凌恩生物资讯|抗性宏基因组又一力作|抗性基因+可移动元件研究新成果!
研究其对生物脱氮性能、微生物群落结构、抗生素耐药基因(ARGs)和可移动遗传元件(MGEs)的影响。原创 2023-02-24 11:43:23 · 443 阅读 · 1 评论 -
凌恩生物经典文章:孟德尔诞辰200周年,Nature Genetics礼献豌豆高质量精细图谱
为豌豆基因组的进化和驯化提供了见解,也为豌豆遗传学和育种的研究提供了宝贵的基因组资源。原创 2023-02-21 15:01:58 · 479 阅读 · 0 评论 -
雁过留痕,竟是病毒的痕迹?
凌恩生物全新升级宏病毒组分析流程,聚焦DNA,RNA病毒组研究热点,助力宏病毒组科研成功!原创 2023-02-09 14:30:36 · 347 阅读 · 0 评论 -
2022 | 高分文章大盘点,值得关注!
凌恩生物10+项目文章来啦原创 2023-02-06 09:24:06 · 117 阅读 · 0 评论 -
科研快报|影响因子7.963!全长16S测序检测硝化污泥颗粒去除EE2的微生物群落变化
大量研究表明,硝化活性污泥(NAS)可去除17α-乙炔基雌二醇(EE2)的污染原创 2023-02-03 11:14:11 · 99 阅读 · 0 评论 -
EVAtlas:人类细胞外囊泡中ncRNA表达的综合数据库
对ncRNA在EV中的分布进行全面调查,有助于了解EV的分子特征并揭示其中的潜在作用。原创 2023-02-01 14:00:52 · 122 阅读 · 0 评论 -
科研快报 | 三代测序技术-海水微生物态,助力海水微生态及微生物基因组研究
通过三代测序对来自地中海的冬季混合海水样本进行宏基因组测序。利用PacBio Sequel II平台的超长读长明显可以提升宏基因组的组装质量,又能显著提升MAGs质量。原创 2023-01-31 09:34:31 · 267 阅读 · 0 评论 -
微刊:做了很多的16S三代测序,文章可以这样写~
凌恩生物全面升级 PacBio Sequel lle 平台,旨在搭建国内一流的组学三代测序数据生产及数据运算中心,为广大科研用户提供优质的三代测序数据及科研服务。原创 2023-01-30 10:01:54 · 446 阅读 · 0 评论 -
科研快报|Cells最新研究报道:三代全长16S测序探究银屑病患者与健康人群血浆EVs微生物组成差别
本文深度报道了中度至重度银屑病(PSOs)患者和健康对照组(HCs)之间血浆源性细胞外囊泡(EVs)中细菌群落的差异。原创 2023-01-29 11:18:00 · 128 阅读 · 0 评论 -
科研快报|PacBio 16S全长测序探究游离唾液微生物群失调在牙周病中的潜在作用
本研究的目的是探讨游离唾液微生物群在不同牙周状态下的潜在作用,它们对非手术牙周治疗的反应,以及治疗后患病个体和健康人体之间的差异。原创 2023-01-20 10:02:57 · 1779 阅读 · 0 评论 -
科研快报|二代加三代扩增子测序探究苏铁植物根部复杂微生物群落组成
利用PacBio三代测序技术,开展全长16S测序原创 2023-01-19 09:51:36 · 1574 阅读 · 0 评论 -
凌恩生物报告升级,科研美图助力群落互作机制研究
通过16S V4-V5区扩增子测序,揭示了顶端捕食者干扰水产养殖系统中浮游细菌群落的反应机制,各位老师请注意关注文章图片哦。原创 2023-01-18 11:18:29 · 506 阅读 · 0 评论 -
精要速览 | PacBio三代全长扩增子测序的多方向研究应用进展
为大家分享多篇基于PacBio三代测序平台开展的全长扩增子研究应用,让我们一起深入了解三代测序技术为微生态研究提供的新方法和新思路!原创 2023-01-17 09:49:21 · 778 阅读 · 0 评论 -
影响因子14.65:16S全长测序+低丰度简化菌群,提供根腐病防控新视角
本研究首先分析了健康和患病黄芪之间根系微生物群落结构的差异,依据患病黄芪根部的低丰度细菌构建了一个简化合成群落,该群落可起到抑制病原菌生长与触发黄芪的宿主植物诱导的系统抗性反应(ISR)的作用,实现降低根腐病发病率的目的。原创 2023-01-10 16:40:52 · 421 阅读 · 0 评论 -
高分综述:人类肠道病毒组分类的进展和挑战
本综述总结了最近可用的四个人类肠道病毒组数据库,并讨论了它们的特征、构建过程和挑战,旨在为研究人员在选择数据库时提供参考。本综述还提出了对病毒种群进行分类的“最佳实践”。原创 2023-01-09 09:05:32 · 505 阅读 · 0 评论 -
数据库|scMethBank:单细胞全基因组 DNA 甲基化图谱数据库
scMethBank作为第一个开放访问的综合数据库,全面整合了不同研究发表的数据,可用于单细胞 DNA 甲基化数据和元数据的收集、整合、分析和可视化。原创 2023-01-05 09:28:17 · 382 阅读 · 0 评论 -
全长扩增子医学版新增内容来啦(二)
Source Tracker溯源分析、微生物与代谢组学的关联分析原创 2023-01-04 09:09:22 · 197 阅读 · 1 评论 -
16S全长测序解密转基因玉米根瘤菌群落组成
利用PacBio测序平台对根际微生物进行测序,旨在解码转基因玉米与根际微生物的相互作用和潜在的生态危害。原创 2022-12-27 10:59:32 · 706 阅读 · 0 评论 -
黄海冷水区微生物群落的季节演替及温度响应模式
为了解温度干扰下的微生物群落的变化模式提供了重要的见解原创 2022-12-26 11:00:23 · 518 阅读 · 0 评论 -
植物激素基因高级分析来啦~
植物激素基因高级分析来啦原创 2022-12-23 10:38:43 · 892 阅读 · 0 评论 -
MicFunPred——最新16S rRNA扩增子数据功能预测数据库
一款综合性的16S rRNA扩增子数据功能预测数据库——MicFunPred原创 2022-12-22 11:37:13 · 739 阅读 · 0 评论 -
比较叶绿体基因组提供海草适应性进化新见解
本研究对三个鳗草属海草的叶绿体基因组(cpGenomes)进行测序,分析、比较三者基因组结构和序列变异原创 2022-12-21 09:43:35 · 694 阅读 · 0 评论 -
生态类型 or 生境类型?16S全长测序判断河流中细菌群落构建机理
本文的结果可以为今后水环境不同生态位微生物群落的研究中选择生态类型还是生境类型作为样本区分的标准提供理论指导。原创 2022-12-20 11:47:32 · 441 阅读 · 0 评论 -
【无标题】
氨基酸的利用是影响肠道微生物分布的决定性因素。原创 2022-12-19 15:19:50 · 552 阅读 · 0 评论 -
对氯间二甲苯酚在活性污泥发酵过程中重塑ARGs的机制类别
主要研究了对氯间二甲苯酚(PCMX)对剩余活性污泥(WAS)厌氧发酵过程中抗生素抗性基因(ARGs)传播的环境风险,并揭示了其中的关键机制。原创 2022-12-14 10:13:05 · 289 阅读 · 0 评论 -
利用全长转录组多重阵列测序检测同源异构体
MAS-ISO-seq 是一种程序化串联cDNA并进行长读段测序的单分子技术原创 2022-12-12 15:51:09 · 532 阅读 · 0 评论 -
凌恩客户文章|JCR 一区:多组学联合分析揭示PCOS真元凶
肠道细菌,肠道真菌及其相互作用可能在多囊症的发生发展中起到重要作用原创 2022-12-09 14:55:08 · 758 阅读 · 0 评论 -
三代全长16s助攻,轻松搞定水体研究领域10+文章
着三代测序势必成为取代二代测序,提升研究品质的必经之选原创 2022-12-08 10:08:44 · 475 阅读 · 0 评论 -
HIFI测序揭示拟南芥MSH1参与介导的细胞器基因组重组与变异积累规律
通过高精度的长读长测序(PacBio HiFi)解释了拟南芥MSH1参与介导的细胞器基因组重组与变异积累规律原创 2022-12-07 09:33:14 · 339 阅读 · 0 评论 -
PacBio HiFi 测序动植物基因组项目真实案例测评
为大家带来HiFi测序在实战中的数据测评原创 2022-12-06 09:43:01 · 648 阅读 · 0 评论 -
16S全长测序揭示绿头虻肠道微生物及共生细菌
通过PacBio 16S rRNA基因全长测序进一步确定其肠道微生物群落的物种多样性原创 2022-12-05 09:24:51 · 402 阅读 · 0 评论 -
数据库 | ATACdb:一个全面的人类染色质可开放性数据库
本研究开发了一个全面的人类染色质可开放性数据库(ATACdb),可以帮助研究人员深入理解表观基因组机制,并在可开放染色质区域发现更多的生物功能原创 2022-12-01 09:43:28 · 505 阅读 · 0 评论 -
利用综合微生物指数评估富营养化危险沿海湿地生态状况
揭示了湿地生态系统对主导压力因子的变化特征;确定压力因子对滨海潮滩湿地生态系统的作用途径。原创 2022-11-30 09:59:34 · 409 阅读 · 0 评论 -
Hifiasm-meta | 你没看错!基于宏基因组的完成图!!
hifiasm-meta软件将进一步推动宏基因组组装原创 2022-11-29 09:52:58 · 375 阅读 · 0 评论 -
加量不加价!扩增子新版分析流程结果解读(二)
加量不加价!扩增子新版分析流程结果解读(二)原创 2022-11-28 10:17:47 · 414 阅读 · 0 评论 -
简单手段发IF=7+文章:磷酸三苯酯对鲤鱼的毒性作用及肠道微生物群落影响
使用16SrRNA测定鲤鱼肠道微生物群落对TPHP应激反应原创 2022-11-25 12:40:40 · 397 阅读 · 0 评论 -
Nature Plants|植物基因组测序20年回顾与展望:三代HiFi基因组时代
陆地植物基因组组装的数量和质量迅速增加,尤其是与三代长读长测序显著相关原创 2022-11-24 11:14:12 · 517 阅读 · 0 评论 -
加量不加价!扩增子新版分析流程结果解读(一)
差异分析和环境因子分析的新增内容原创 2022-11-23 13:49:38 · 181 阅读 · 0 评论