千呼万唤的线粒体基因组完成图

凌恩生物提供各类物种的线粒体DNA的富集和抽提,从前期样本制备到后期生物信息分析,都致力于为客户提供最专业的服务。

线粒体相关介绍

线粒体(mitochondrion,mtDNA)是一种存在于大多数真核生物中的由两层膜包被的细胞器,是细胞中制造能量的结构,是细胞进行有氧呼吸的主要场所。大多数真核细胞或多或少都拥有线粒体,但它们各自拥有的线粒体在大小、数量及外观等方面上都有所不同。

不同生物线粒体的结构特点:

植物:300~1000kb,基因组内有很多重复序列,基因结构复杂,编码区占比低,是目前组装和注释难度最高的小基因组

藻线:基本在100kb以下,基因组重复序列少,基因区结构较简单

真菌:比较小,常见的在30~120kb,物种间序列变异较大,基因数不多但结构较为复杂

动物:常见的大小在15~16kb,基因排列紧凑,会出现部分基因区的重叠,没有或很少的基因间隔序列

常见的圈图如下:

真菌线粒体圈图例图.pdf

植物线粒体圈图例图.png

动物线粒体圈图例图.png

分析流程

公司优势及项目经验

公司已经完成及在线的线粒体已经超过80个,动物和植物线粒体较多;其中96%以上的样本组装到完成图水平。

统计目前已完成及在线的线粒体物种分布,植物线粒体分布于5种不同的科,主要物种如水稻、玉米、胡萝卜、棉花、小麦等;动物线粒体分布于15种不同的科,如一些海产品(比如鱼、海胆)和鸟类、软体动物等。

藻类线粒体项目的物种分布主要是金球藻、红球藻和其他一些水藻。

项目类型物种拉丁名
植物线粒体藻科Chlorellaceae;Palmellaceae
黍亚科Panicoideae;Panicodae
禾本科Poaceae;Gramineae
豆科Fabaceae;Leguminosae
伞形科Apiaceae;Umbelliferae
藜科Chenopodiaceae
项目类型物种拉丁名
动物线粒体蚶科Arcidae
蛔科Ascaridae
鱼类Fish
石鳖Chiton
竹鼠科Rhizomyidae
鸠鸽科Columbidae
天牛科Cerambycidae
笠贝科Acmaeidae
水母科Rhizostoidae
甲壳类Crustaceans
绦虫类Cestoda
海胆类Echinoidea
刺鲀科Diodontidae
蜂类Bees
线虫类Nematode
书虱科Liposcelididae
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