1.生物信息数据库:是用于生物信息学研究的原始数据,是生物信息学赖以生存和发展的基础。生物数据库主要是对生物信息的收集、存储和管理的研究,包括国际基本的生物信息库和生物信息传输国际物联网系统的建立,生物信息数据库质量的评估与检测系统的建立,生物数据可视化和专家系统,生物信息工具开发。NCBI是推动基因组、计算生物学和数据分析方面的软件开发,发布生物医学领域的信息,为生物医学和生命科学研究提共了大量分析所需要的数据和工具。
2.序列比对:是生物信息学的基本操作,按照一定的标准将符号序列对齐,以分析多个序列之间的相似性。一般多多核酸序列或者蛋白序列进行操作对象。序列比对的理论基础是:进化学说。如果序列之间的比对相似性足够高,我们就可以推测序列之间拥有共同的祖先,经过残基替换、缺失、添加或者序列重组等遗传变异演化而来。此外,还可以通过未知序列与已知序列之间的比对,来预测未知序列的功能。
3.蛋白质结构预测:是从蛋白质中的氨基酸序列预测其三维空间结构。蛋白质的生物学活性很大可能性是取决于它的空间结构,可以根据空间结构的预测,进一步预测其生物学功能,并进一步进行功能蛋白的合成。目前对于蛋白质结构的预测主要是依赖于X线晶体衍射和磁共振,但只能预测特定性质的蛋白质,而且周期性很长,远不及核酸检测迅速。因此,基于核酸检测的研究逐渐成为生物信息学研究的热点,这个是趋向于计算机结构预测的方向。
4.生物芯片:是分子生物学、物理学、微电子学交叉形成的高新技术。