Python生物医学专业案例 - 细胞计数

在上公共的编程基础课时，我们经常受到学生的质疑: 我们学这玩艺儿有什么用？ 学生的疑问来自于“他没有从课程中得到通过程序设计来解决本专业问题的体验”。重庆大学的教学团队设计了很多与各专业紧密相关的程序设计案例，我们会陆续分享出来，供大家参考。

本文引用自作者编写的下述图书; 本文允许以个人学习、教学等目的引用、讲授或转载，但需要注明原作者"海洋饼干叔
叔"；本文不允许以纸质及电子出版为目的进行抄摘或改编。
1.《Python编程基础及应用》，陈波，刘慧君，高等教育出版社。免费授课视频 Python编程基础及应用
2.《Python编程基础及应用实验教程》, 陈波，熊心志，张全和，刘慧君，赵恒军，高等教育出版社Python编程基础及应用实验教程
3. 《简明C及C++语言教程》，陈波，待出版书稿。免费授课视频

（在原始案例中，代码中间留空让学生填写，这里的代码是完整的）

一幅细胞照片经过二值化以后可以视为像素值为0或1的矩阵，如图21-1所示。在该矩阵中，值为1为元素表示该处是细胞或细胞的一部分，该元素的上、下、左、右的相邻元素如果也是1，则相邻元素与该元素位于同一个细胞内；矩阵中值为0的元素表示该处无细胞。识别并统计显微镜下一幅细胞照片中的细胞数量，是血液常规检查的最基本任务之一。

对于图21-1所示的细胞照片，按上述规则，容易数出该幅照片中包含7个细胞。注意，第3行第3列是一个孤立细胞（图中已用底纹区分），它与第2行第5列的细胞并非同一个，因为它位于第2行第4列元素的左下方，而不是上下左右的位置。

在本实验对应的实验子目录中有一名为cellpicture.txt的文本文件，其内容为细胞照片的二值化矩阵。请编写程序，从该文件读取矩阵内容并统计该矩阵中的细胞数量。

该文件的内容如下：

12 14
10111000011100
01100110001101
00000111000011
00110000001000
00011000111000
00111100010011
10011101100111
11000100000001
00000000011000
00000000000000
10001100110000
10001000011111

其中，第1行的1214以空格分隔，表示该矩阵有12行14列。接下来，则是12行元素数据，每行14个0/1字符。

21.1 从文件读入二值化矩阵

下述程序负责从文件cellpicture.txt中读取二值化矩阵，并将其组织在嵌套列表d中。请将程序补充完整并运行，确保矩阵d的内容与文件一致。注意，矩阵元素的类型应为整数。

d = []
with open('cellpicture.txt') as f:
    m,n = map(int,f.readline().split())
    for x in range(m):
        r =