(一)Materials Studio材料模拟软件介绍
Materials Studio(简称MS)是分子模拟领域内的多种模拟方法以及建模可视化性质分析工具。提供三维结构模型,对各种晶体、无定型以及高分子材料的性质及相关过程进行深入的研究。可以从电子、原子以及高分子的角度去分析物质的结构与性质 利用的主要方法为:以密度泛函为主的量子力学模拟方法、分子力学和分子动力学模拟方法、蒙特卡罗模拟法、介观动力学(MesoDyn)和耗散粒子动力学(DPD)、统计方法QSAR等多种先进算法和X射线衍射分析等仪器分析方法,根据系统中的原子、分子的类型和数目,研究、预测材料的相关性质。模拟的内容包括了催化剂、聚合物、固体及表面、界面、晶体与衍射、化学反应等材料和化学研究领域的主要课题。
(二)Materials Studio软件计算特点
2.1 MS求解器支持单机CPU、GPU卡、MPI多机集群情况
如何配置一台具有高性能能力的图形工作站(CPU、内存、硬盘、显卡),需要对其算法特点、以及计算规模进行分析
No |
分类 |
模块 |
功能描述 |
CPU并行 |
GPU加速 |
集群 |
1 |
可视化分析 |
Materials Visualizer |
材料可视化工具 搭建分子、晶体及高分子材料结构模型 |
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2 |
量子力学类 |
DMol³ |
密度泛函量子力学程序原子轨道线性组合法,计算能带、态密度 |
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CASTEP |
材料科学量子力学程序平面波赝势密度泛函法,模型较小,包含数十、乃至数百个原子 |
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NMR CASTEP |
MS CASTEP的扩展模块 晶胞进行几何优化,若精度要求较高 |
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ONETEP |
进行线性标度密度泛函模拟 |
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DFTB+ |
半经验量子力学程序 密度泛函的紧束缚法模拟体系大,对数千个原子体系进行模拟 |
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VAMP |
半经验量子力学程序 原子轨道线性组合方法,对于涉及电子得失或转移的过程(诸如涉及化学反应的过程)的模拟 |
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Cantera |
化学反应速率方程求解器 |
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QMERA |
量子力学与分子力学的杂化方法 |
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3 |
分子力学与分子动力学类 |
COMPASS |
对凝聚态材料进行原子水平模拟的功能强大的力场,模型中等大小,包含数千至数万个原子 |
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Forcite Plus |
分子和周期性体系的经典力学模拟工具 |
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