fMRI快速事件相关实验设计之自动生成事件序列optseq2

optseq2命令

OptSeq2是freesurfer软件附带的快速事件相关实验的事件序列生成命令。该命令包含7个主要参数，如下所示：

1， TR (--tr)
2， Number of timepoints (--ntp) 总时间点数目
3， Range of allowable ISIs (--PSDwin) 两个事件之间的事件间隔，psdwin psdmin
4， Event definitions (--ev) 事件定义，包括：事件名称、持续事件和重复次数
5， How long to simulate (--nsearch) 生成的用于挑选的序列总数
6， How many timing files to keep (--nkeep) 保留的最优的序列数目
7， An output prefix with which to label the timing files generated (--o)

一个实例

optseq2 \
--ntp 200 \
--tr 2.0 \
--psdwin 2 4 \
--ev condA 2 30 \
--ev condB 2 30 \
--nsearch 100000 \
--nkeep 3 \
--o best

（参考链接：https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/optseq/）