Linux中pdb文件生成dssp文件

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分类专栏： 生信 文章标签： 人工智能
于 2022-03-09 10:30:18 首次发布
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Linux中pdb文件生成dssp文件

step1: 进入Uniprot下载相应蛋白质的pdb文件
step2: conda创建虚拟环境
step3: 虚拟环境中安装dssp

conda install -c ostrokach dssp

step4: 进入mkdssp所在文件夹中

which mkdssp
cd xxxxx

step5: 执行命令

dssp -i input.pdb -o out.dssp

在这里插入图片描述

补充：python批量pdb文件生成dssp

# -*- coding: utf-8 -*-

import os


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