Centos 环境 JBrowse 的安装
1. 安装依赖包
sudo yum groupinstall "Development Tools"
sudo yum install libpng-devel gd-devel zlib-devel perl-ExtUtils-MakeMaker
2. 下载 JBrowse 的安装包
2.1 本地下载
2.2 代码下载
mkdir -p /var/www/html/jbrowse
cd /var/www/html/jbrowse
curl -L -O https://github.com/GMOD/jbrowse/releases/download/1.16.8-release/JBrowse-1.16.8.zip
3. 解压编译执行
unzip JBrowse-1.16.8.zip
sudo chown `whoami` jbrowse
cd JBrowse-1.16.8
./setup.sh
./setup.sh 这条代码的过程中需要下载 perl 依赖的包, 需要很长时间. 可以查看当前路径下的
setup.log
这个文件查看进度, 若安装失败则可以查看原因.
成功后
4. 访问
4.1 安装 NGINX
4.2 修改 nginx.conf
路径: /var/www/html/jbrowse/JBrowse-1.16.8
向 nginx.conf 文件中添加的内容:
location ^~ /JBrowse-1.16.8/ {
root /var/www/html/jbrowse/;
index index.html index.htm index.jsp;
}
路径
/var/www/html/jbrowse/JBrowse-1.16.8
中的JBrowse-1.16.8
一定要与location ^~ /JBrowse-1.16.8/
中JBrowse-1.16.8
保持一直
检验, 执行 nginx
4.3 访问
http://IP/JBrowse-1.16.8/