1.零假设和p值
零假设:在随机条件下的分布。
p值:在零假设下,观测到某一特定实验结果的概率称为p值。
2.为什么高通量实验中p值存在问题?
p值只对一次实验结果有效,如果是多重假设检验需要进行校正。
3.多重假设检验校正。
邦弗朗尼校正:p值小于显著性阈值/n(在零假设中至少有一个的得分会大于观测值的概率为显著性阈值,即我们有1-显著性阈值的概率可以确定在零假设中不会出现比观测值大 的值。所以如果出现了比观测值大的值可以认为是随机误差产生的。)(控制FWER)
Benjamini-Hochberg过程:设总共有m个候选基因,每个基因对应的p值从小到大排列分别是p(1),p(2),...,p(m),则若想控制fdr不能超过q,则只需找到最大的正整数 i