一款使用sklearn基础包机器学习糖尿病患者体内微生物含量数据的软件

最新推荐文章于 2023-02-06 07:00:54 发布

北京生信课堂

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分类专栏：生物信息文章标签：机器学习生物信息

本文链接：https://blog.csdn.net/a_giant_pig/article/details/101297529

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本文介绍了一种利用sklearn机器学习库分析糖尿病患者体内微生物含量的方法。通过对4400名个体的数据进行建模，尝试通过微生物的百分比差异区分健康与糖尿病状态。数据源来自宏基因组测序技术，模型旨在基于微生物含量预测疾病状态。

摘要由CSDN通过智能技术生成

微生物与人类共生，对人类的健康影响重大，人体内各类微生物的含量和状态应该保持稳态，除非人体患病。

目前二大测序技术的广泛普及，从患者体内获取样本直接测宏基因组的含量变得非常可行。

我获取了4400名健康和患糖尿病的数据，体内的微生物含量以及换算成百分比，加和比例接近1。使用sklearn机器学习包，为4400个样本建立模型，希望通过机器学习来区分健康与糖尿病患者，仅仅根据他们体内的微生物含量数据。

数据的一部分，保存为abundance.txt

下面上代码

import warnings
import pandas as pd
import random
import sys
from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier
import numpy as np

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