生物信息之基因组，转录组，蛋白质组学全面教程（第1节课）：生物信息基础知识

生物信息之基因组，转录组，蛋白质组学全面教程（第1节课）：生物信息基础知识

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同学们好，接下来介绍一下学习本课程的基础。

学生应该有的背景：

数学

统计学

计算机

纯生物学

准备或者已经在学习生信硕士课程（包括海外各大学，非常推荐，优先推荐比利时，德国等国家。优点是几乎无学费，但需要学会德语及法语等小语种）。

订阅本专栏之后，在申请海外院校的硕士时，可以得到作者的亲身指导哦。

本教程包含的知识范围：

数学

统计学

计算机科学

生物学

首先明确一下我们为什么学习生物信息。

随着二代测序，三代测序，甲基化测序等测序手段的飞速进步，测量一个人的DNA，RNA，Protein信息变得异常廉价。进而导致生物信息数据呈现指数增加。如何分析这些海量的数据，得到对我们有用的信息是生物信息从业者的核心任务。

我适合学生物信息吗？
生物信息从字面上理解是生物学和信息学的交叉学科。但首先我们必须喜欢生物学，否则你会觉得寸步难行。
好的既然你已经喜欢上了生物学，那么你喜欢计算机，数学和统计学么？
你的回答可能模模糊糊，有的人甚至已经开始打退堂鼓。数学啊，我上大学时高等数学好不容易补考才过那，同学们心里可能这么想 ☺。这里喜欢并不是必须的，有很多生物信息从业者平时几乎不用数学，而且对于这些学科的兴趣是可以慢慢培养的。如何培养那？通过使用数学，计算机等实践解决了生物信息问题，这会给同学们带来成就感和新鲜感，逐渐的变成习惯，从而最终喜欢上这些理学知识。当然这只是理想情况。

常见的生物信息工具类型。

工欲善其事必先利其器。为了解决生物信息问题，我们需要挑选适合我们的工具或者编写自己的工具，但是在学习的初级阶段几乎不可能。工具的类型大体上分为网页版APP，命令行APP和编程语言如python，R，C++等三种。

网页版APP，带用户界面的电脑或者手机APP。 不需要懂得编程语言，一般总能确保使用的是最新版本工具，总体使用难度低。通常一键运行或者阅读user manual就能运行工具。可以轻松访问很多大型数据库。

常见的网页APP如下：

Genome browsers
(NCBI, UCSC,
Ensembl)

(Partek, MEGA,
RStudio,
BioMart,
IGV)，Galaxy

命令行APP，程序语言R，C++或者python。常见的如GATK等。相比较网页版工具的优势是灵活性，可以清晰的梳理分析过程，可以处理大型文件而不用担心有的文件过大比如几十个GB无法上传网页的问题，不受网络环境比如网速或者有的国外域名限制中国IP登录等问题。

生物信息从业者的日常工作内容。

• 生物信息工程师（薪资10K-25K）
  编写脚本处理日常运算或者数据库增删改查，维护服务器生成任务的正常运行，阅读生物信息算法文献。