windows平台 BLAST Database creation error: mdb_env_open: 磁盘空间不足。

最新推荐文章于 2024-06-14 09:40:43 发布
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#blast #windows

博客内容提到，从blast+2.10.1版本开始遇到运行错误，尝试修改环境变量和使用全英文路径等方法无效。解决方案是安装并使用2.9.0版本，通过下载、解压并将bin目录添加到环境变量即可正常使用。

blast+ 2.10.1往上版本就是会报错
改环境变量到1000000，
以及绝对路径都英文之类的不管用。

安个低于2.10的版本，2.9.0就可以
下下来，解压，把bin加入环境变量即可用。
https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/2.9.0/

BLAST Database error: No alias or index file found for nucleotide database [nt] in search path解决办法
高端的博客
11-14 3万+
Blast网页版做生物信息的应该都用过，输入你想比对的序列或者fasta文件提交网页就能出来结果。 但如果你想用blast的命令行模式，用法会跟网页版非常不一样。新手会遇到很多问题，遇到频率最高的应该就是我这篇文章想说的问题BLAST Database error: No alias or index file found for nucleotide database [nt] in searc...
blast database error:
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11-18 1718
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09-06 4655
Traceback (most recent call last): File "./scripts/create_lmdb.py", line 143, in <module> create_lmdb(args.dataset, raw_dir, lmdb_dir, filter_file) File "./scripts/create_lmdb.py", line 65, in create_lmdb txn.commit() lmdb.Error: mdb_txn_
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BLAST_FDR:BLAST_FDR和PSI-BLAST_FDR是BLAST和PSI-BLAST的变体-开源
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