【生物信息】蛋白质交互课题思路成长营(14天)

背景

在直接机制研究中,有四种二元交互的典型模式:蛋白结合DNA、蛋白结合蛋白、RNA结合RNA、RNA结合蛋白。在我们的日常科研中,作为生物功能的直接行使者,主要依赖的是蛋白质之间的相互作用。

当蛋白-蛋白交互发生在细胞核内,多半跟转录调节有关,主变量即便不是转录因子,它的交互变量也可能是转录因子;如果是发生在细胞浆的,就是执行各种生物学功能,包括传递各种信号。如果是与胞膜蛋白的胞内段发生交互,就是信号的感受。分泌到胞外,就是介导细胞交互。

至于多重嵌套组合的研究流程,也并不是做完了间接调控的变量要素串联,再来探究局部的直接机制细节,而这是因为有调控关系未必有交互作用。通常情况下,研究中往往会采用先难后易的解决思路,即先确认直接机制的二元交互对象,再从交互的二元变量延伸出上下游的间接机制要素。

而为了让大家更好的领悟蛋白间交互的研究套路,本期训练营通过14天的课程学习,以蛋白交互研究的经典案例为引,详细拆解蛋白结合蛋白这种经典的直接作用机制研究套路,同时也总结推出通用研究框架和蛋白交互选题思路,便于大家将所学的套路灵活应用到自己的课题设计之中。

同时,课程中也会从读题猜要素、看图对恒量、分组辨套路、读题识变量、看图解机制、结果推结论、检索探背景、溯源揭创新这八个层次来对文章进行解读。另外,也会通过解读文献数据的内在逻辑,来抓取文章关键信息,并以模块化思路领会文章数据的逻辑观点与说理套路。这样通过将套路理论与经典文献相互搭配,相信大家能对蛋白交互研究理解的更为透彻。

然后课程也介绍了蛋白交互的常用数据库STRING,以及蛋白交互研究常规实验co-IP和GST Pulldown的具体方法,相信学员学习之后能将其灵活应用至自己的研究中,后续才能产出独属于自己的SCI。

本期训练营共14天,每天晚上18:00发布学习任务,我们每天会安排1-2节课的学习,每课时在30分钟左右,干货多多;每节课还有对应的课后练习题,大家在看完课后记得做题检验下学习效果哦!学习过程中建议大家备好纸笔,随手做笔记哟~ 学完把笔记或者练习题截图发到群里打卡,我们也会在群里每天提醒大家学习打卡的!

第1节:学习第一章文章套路宏观框架的第5与1节

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