RIP 技术用于定位体内的RNA-蛋白质相互作用。将所关注的RNA结合蛋白(RBP)与其结合的RNA一起进行免疫沉淀,鉴定结合转录RNA(mRNA、非编码 RNA或病毒RNA)。可以通过实时PCR、微阵列或测序检测。
RIP实验步骤:
一、裂解样本
1. 细胞生长约90%覆盖度,细胞计数,收件约1× 10 ^7细胞;
2. 1000 ×g,4 °C离心5min,弃上清;
3. 用1× 预冷PBS洗两遍,弃上清;
4. 用等体积的1×PLB裂解液重悬细胞,轻轻吹散,冰浴5min;
5. −80 °C冻存,样品也可以在−80 °C放置数月。
二、磁珠-抗体复合物制备
1. 振荡混匀Protein A/G琼脂糖珠,根据样本数各吸取40ul到1.5mL离心管中;用0.5ml NT-2洗涤两遍。
2. 用100ul NT-2重悬