TargetScan是一款用于预测哺乳动物中miRNA结合位点miRNA结合位点的软件;今天以“人的GAPDH”为例简单粗暴的给大家介绍一下如何利用TargetScan预测miRNA的结合位点:
目的:已知目的基因,预测能与该基因相互作用的miRNA及miRNA的结合位点。
网站:http://www.targetscan.org/vert_80/
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点击上方的链接进入“targetscan”网站
2.在“Select a species ”选择研究的物种信息;如下图选择“Human”
3.输入需要预测的基因名或者输入ENST编号;如下图输入“GAPDH”
4.若无感兴趣的miRNA,则直接点击“submit”;软件会列出预测到所有与“GAPDH”结合的miRNA信息及位置;如下图