kaggle比赛：HuBMAP - 进击的腰子

HuBMAP - Hacking the Kidney
Identify glomeruli in human kidney tissue images

在人体肾脏组织图像中识别肾小球

赛题介绍

是人类生物分子图谱计划HuBMAP的一部分，希望以单细胞分辨率绘制人类肾脏图谱开始。
…
总之就是大大的好处，造福人类千千万。

奖金

就是特别特别多money

数据集

26G数据集：https://www.kaggle.com/c/hubmap-kidney-segmentation/data

评估

这个比赛使用平局Dice系数来评估。Dice系数可用于像素级比较predicted segmentation与其对应的ground truth之间的一致性。
公式：

其中X是像素的预测集合，而Y是ground truth。当X和Y都为空时，将Dice系数定义为1。排行榜得分是测试集中每个图像的Dice系数的平均值。

提交文件

为了减小提交文件的大小，官方使用行程编码（run-length encoding）对像素值进行度量。只需要提交包含起始位置和行程长度的值对，不需要提交分割索引的详细列表。例如，“ 1 3”表示从像素1开始，总共走3个像素（1,2,3）。

注意，在编码时，mask应该是二进制的，这意味着图像中所有对象的mask都将合并为一个大的mask。值为0表示not masked的像素，值为1表示masked的像素。

比赛格式要求使用空格来分隔每个值对，例如，“1 3 10 5”表示像素1,2,3,10,11,12,13,14将被包括在mask中。度量标准检查值对是否已排序、为正值、以及解码的像素值是否重复。像素从上到下编号，然后从左到右编号：1是像素（1,1），2是像素（2,1），依此类推。从上到下,从左到右依次为像素值编号：1是像素（1,1），2是像素（2,1），依此类推。

该文件应包含标头，并具有以下格式：

img,pixels
1,1 1 5 1
2,1 1
3,1 1
etc.

即：将宽为w高为h的图标每个像素一次编号为[1, w*h]，然后从编号1开始走，走到第一个mask值开始计算行程长度到非mask，如此为一个值对，（比如编号10到14为mask，一共有5个像素，就记为一个值对：10 5），直到编号w*h结束。