研究前沿| scNanoCOOL-seq：单分子测序平台的单细胞多组学测序技术

scNanoCOOL-seq

2023年9月12日，汤富酬课题组在Cell Research上发表了题为“scNanoCOOL-seq: a long-read single-cell sequencing method for multi-omics profiling within individual cells”的论文，首次报道了scNanoCOOL-seq单细胞多组学测序技术。该技术整合了三代测序平台（单分子测序平台）和scCOOL-seq原理，能够实现在一个单细胞中同时精准检测基因组（拷贝数变异）、DNA甲基化组、染色质可及性以及转录组等多个组学层面的信息。

技术原理

     scNanoCOOL-seq技术主要采用亚硫酸氢盐转化和单接头PCR扩增的策略，最终获得长度约为900bp的基因组DNA扩增片段。scNanoCOOL-seq技术实验流程总结ru：

1）通过温和的方式进行细胞裂解和体外M.CviPI酶加甲基化后，进行单细胞的核质分离；

2）单细胞的细胞核部分经过亚硫酸氢盐处理和类PBAT策略的单接头扩增后用于Nanopore平台的单分子测序；

3）单细胞的细胞质部分用于scRNA-seq文库构建（优化的STRT-seq）后进行转录组检测（图1）。