宏病毒组
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武汉百易汇能生物科技有限公司,在科学研究服务领域,可提供基因组学研究(人/动植物/微生物)、转录调控研究(mRNA,lncRNA,m6A等),表观遗传研究(Chip-Seq,全基因组甲基化,ATAC-Seq,6mA等),单细胞研究(10x 单细胞,10x空间转录组),质谱(蛋白质组,代谢组)等相关服务;在临床及应用检测领域,公司开发了一套关于已知及未知病毒检测的解决方案, 其广泛应用于人类及动物已知病毒的鉴定及未知新病毒的监测。
公司目前与国内知名研究机构和药企合作,致力于创新且极具应用前景的病毒生物标志物开发,用于临床疾病诊断和肿瘤早筛等。
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宏病毒组组学知识分享(一)
宏病毒组学 (ViralMetagenomics) :是在宏基因组学理论的基础上,结合现有的病毒分子生物学检测技术而兴起的一个新的学科分支 ,是某类样本中所有病毒 (virus) 或病毒类似物 (virus-like-particle) 及其所携带遗传信息的总称。原创 2022-11-28 17:23:32 · 607 阅读 · 0 评论 -
宏病毒组(五)|病毒基因组系统发育树
目前宏病毒组个性化分析内容主要有:病毒基因组系统发育分析、病毒功能基因分析、病毒互作网络图分析、病毒(噬菌体)宿主预测等。本文给大家带来的是病毒系统发育分析,扫码关注,更多宏病毒组个性化分析详解将陆续给您推送。原创 2022-12-26 09:05:45 · 1145 阅读 · 0 评论 -
宏病毒组(四)|病毒注释软件介绍
宏病毒组直接以样本中所有病毒的遗传物质为研究对象,快速鉴定样本中所有的病毒组成。测序数据的组装及病毒的分类注释直接影响项目分析结果的准确性。在上篇推文中小编给大家详细介绍了组装软件——Megahit超详细安装及应用教程,接下来给大家介绍2款常见的病毒分类注释软件。原创 2022-12-26 08:54:32 · 2246 阅读 · 0 评论 -
宏病毒组(三)| 数据组装软件使用教程
测序得到大量的宏基因组/宏病毒组数据后,我们均需要组装后进行物种注释及基因注释。目前主流的组装软件有megahit、metaspades等。其中,MEGAHIT是超快的宏基因组序列组装工具,成为行业的主流组装软件。原创 2022-12-12 10:48:00 · 999 阅读 · 0 评论 -
宏病毒组(二)|样本前处理
由于病毒核酸在样本中的相对含量非常低,容易受到宿主基因组的严重干扰,且病毒的结构具有独特性,缺少具有固定保守的进化标记基因,无法通过保守的基因分析来鉴定分类信息,使得宏病毒组研究从样本制备开始到数据分析都存在着一定的困难。目前,从样本制备层面主要有病毒样颗粒(VLP) metagenomes 和 Bulk metagenomes两种。原创 2022-12-05 14:06:15 · 535 阅读 · 0 评论