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原创 nature communications |多层次蛋白质组分析揭示弥漫型和肠型胃癌之间的分子多样性

胃癌是世界上主要的癌症类型之一。弥漫型胃癌(DGC)和肠型胃癌(IGC)是胃癌(GC)的主要组织学类型，DGC呈分散的细胞组织，黏附差，细胞分化差，而IGC呈管状或腺状细胞组织，黏附连接紧密，基质成分较少。DGC和IGC不同的病理生理和分子特征提示其不同的致癌机制。尽管已有大量基因组和转录组研究揭示了胃癌的分子特征，但DGC和IGC在分子病理学上的差异仍然不甚清楚，这限制了新生物标志物和药物靶点的发现。

2024-09-18 16:17:25 426

原创合作文章|基于FFPE样本研究腹水微生物群与HCC继发腹水、PVTT之间的相互作用

肝细胞癌(HCC)是最常见的恶性肿瘤之一，也是全球医疗保健面临的主要挑战。尽管已经取得了重大进展，但仍有改进的空间，特别是在开发系统治疗方面。恶性腹水是晚期HCC的严重并发症，由腹膜转移引起，一直是HCC治疗的重大临床挑战。已有研究报道，门静脉瘤栓(PVTT)形成经常导致腹水、门静脉高压和肿瘤转移。大约10%-40%的HCC患者检测到PVTT，并且是预后不良的标志，因此寻求治疗PVTT和HCC引起的恶性腹水的新策略是很重要的。

2024-09-09 16:01:30 310

原创影响因子14.7！转录组和微生物组学纯分析!

炎症性肠病(IBD)为累及回肠、直肠、结肠的一种特发性肠道炎症性疾病。临床表现腹泻、腹痛，甚至可有血便。本病包括溃疡性结肠炎(UC)和克罗恩病(CD)。粘膜水平上宿主-微生物相互作用的破坏是IBD病理生理的关键。本研究对收集的肠道活检组织进行了转录组学(RNA-seq)和微生物(16S-rRNA-seq)分析，旨在全面研究IBD患者粘膜基因表达与微生物群之间的互作关系。作者结合了这两个组学数据，并通过将这些数据与广泛的临床特征相结合，对粘膜宿主-微生物相互作用进行了全面的研究。

2024-09-04 10:38:01 188

原创合作文章（IF=7.7）|非靶+靶向+16S +RNA-Seq探究广东虫草对非酒精性脂肪肝的功效

肥胖症的持续增长已成为一个全球性的公共卫生问题，世界卫生组织(WHO)报告称，全球超过八分之一的人患有肥胖症。目前，全球范围内代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)，以前被称为非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)，随着肥胖的流行而急剧增加，影响了大约25%的世界人口。生活方式干预，如节食和增加体力活动是预防和治疗肥胖和MASLD的主要选择。近年来，功能性食品通过调节肠道菌群、宿主基因表达和代谢活动，改善肥胖及相关并发症的生理和病理反应，引起了越来越多的关注。

2024-08-26 13:58:09 784

原创 IF=12.2|“阴道播种”有益于婴儿健康？

将剖腹产婴儿暴露于母体阴道微生物群，称为“阴道播种”(VS)，这是一种将阴道微生物群转移给新生儿的方法，而剖腹产是无法获得阴道微生物群的。有研究表明表明，阴道播种允许母体菌群植入剖腹产分娩婴儿的多个身体部位，并改变微生物群的发育轨迹，更接近阴道分娩的婴儿。目前尚不清楚阴道播种对微生物群的恢复是否会降低剖腹产相关代谢和炎症疾病的风险。因此，本研究在小鼠模型中通过代谢组学和16S rRNA测序评估了人类婴儿阴道播种对肥胖和肠道微生物的影响。

2024-08-20 17:11:32 294

原创合作文章（IF=14.3）|RNA-Seq和ChIP-Seq助力SOX12调节肝癌细胞的机制研究以及肝癌联合治疗的免疫策略的发现

肝细胞癌(HCC)是全球严重的健康负担。长期以来，HCC的治疗选择很少，但免疫检查点阻断(ICB)近年来取得了重大突破。在肿瘤免疫微环境(TIME)中，免疫细胞通过配对的免疫检查点或其他信号与肿瘤细胞相互作用，形成异质的免疫抑制生态系统，促进肿瘤的进展和转移。迄今为止，ICB的低应答率和免疫毒性严重阻碍了其在HCC患者中的应用，强调了解HCC细胞与免疫细胞相互作用的必要性。

2024-08-13 17:21:28 412

原创合作文章（IF=5.9）|16s和非靶代谢组分析揭示亚麻籽木脂素对PAM过量诱导的肝毒性的保护作用

扑热息痛（PAM）是世界上最常用的镇痛解热的药物之一。在肝酶细胞色素P450 Cyp2E1和Cyp1A2PAM酶的作用下，PAM转化为一种高活性的代谢物乙酰对位苯醌亚胺(NAPQI)，通过与谷胱甘肽(GSH)偶联可解毒为无毒的谷胱甘肽-NAPQI。然而，PAM过量使用时，过量的（NAPQI）消耗GSH储存，不可逆地与肝细胞蛋白结合，并通过产生活性氧(ROS)引起氧化损伤，导致肝细胞凋亡和坏死。关于亚麻籽木脂素在多大程度上减轻PAM引起的肝损伤，以及它与肠道菌群和代谢物的变化之间的关系，文献报道较少。

2024-08-05 17:19:35 867

原创 Nature Medicine：检测一滴血中的蛋白质，预测50多种疾病未来十年的发病风险

分析结果显示，对于其中67种病理各异的疾病，包含这5-20种蛋白质的稀疏模型的预测性能优于使用基本临床信息开发的模型，包括基于血细胞计数、胆固醇、肾功能和糖尿病检测（糖化血红蛋白）的预测模型。临床上推荐的预测疾病发病风险的工具被广泛用于心脏病发作和卒中，但很少用于其他疾病。在过去几十年里，单一血浆蛋白已被确定为少数疾病的特异性诊断方法，包括用于心力衰竭诊断的B型利钠肽（BNP），用于急性冠脉综合征诊断的肌钙蛋白，以及用于创伤性脑损伤的泛素C末端水解酶L1（UCH-L1）和胶质纤维酸性蛋白（GFAP）。

2024-07-29 10:39:41 621

原创成功案例|单细胞转录组学助力肥厚性心肌病的研究

肥厚性心肌病(HCM)是一种常见的遗传性心血管疾病，以左心室肥厚为特征，通常由编码肌节蛋白的基因突变引起。目前研究尽管在了解HCM的遗传基础方面取得了重大进展，但对HCM发病机制相关细胞过程的分子基础了解仍不完整。单细胞RNA测序(scRNA-seq)为更深入地了解包括心脏病在内的人类疾病提供了新的机会。

2024-07-22 14:46:01 288

原创因胖得福？Nature：肥胖竟能提高肿瘤免疫疗效，但也会增加患癌风险！从多国自然热点角度切入，发现肥胖是“双刃剑”

肥胖与13种以上癌症的进展和转移相关，在PD-1阻断免疫疗法中具有独特表现，即肥胖悖论。当前研究大多关注肥胖对T细胞表型的影响，却忽略了肿瘤微环境和脂肪组织中巨噬细胞的作用。本研究深入探索肥胖相关癌症中TAM（肿瘤相关巨噬细胞）的作用，将有助于更全面地理解肥胖与癌症之间的关系，为未来的治疗策略提供新的思路。

2024-07-15 14:05:29 801

原创 Nature重磅：揭开睡眠不足为什么会损害记忆力

2024年6月12日，密歇根大学安娜堡分校的研究人员在Nature期刊发表了题为：Sleep loss diminishes hippocampal reactivation and replay的研究论文。该研究发现，在睡眠不足时，一个与长期记忆有关的关键大脑信号——海马体的尖波涟漪，会被减弱，这有助于解释为什么睡眠不好会扰乱记忆形成，经过一夜糟糕的睡眠后，即使恢复正常睡眠，也不足以修复这一大脑信号。这项研究可能会带来改善记忆的靶向治疗方法。

2024-06-24 10:38:49 806

原创成功案例（IF=5.7）| mNGS预测小儿重症肺炎患者抗菌素耐药性

抗菌素耐药性（AMR）是对儿童健康的一个主要威胁，由于过度或不适当地使用抗生素，与呼吸道感染相关的抗菌素耐药性发病率的增加已成为一个日益关注的临床问题。因此，准确识别病原体和抗菌素耐药性是靶向抗生素治疗的关键。近年来，宏基因组下一代测序技术（mNGS）已被开发出来，用于直接检测临床样本中的微生物核酸，具有同时检测微生物和耐药基因或突变的能力。在血液感染、中枢神经系统感染、呼吸道感染和其他疾病中检测病原微生物方面，mNGS已被证明比传统培养方法具有更高的敏感性。

2024-06-17 16:37:16 327

原创成功案例（IF=7.3）| mNGS揭示肺移植受者气道分泌物的微生物特征

虽然第一例人类肺移植是在1963年进行的，但直到20世纪80年代中期，在克服了大多数手术和药理学挑战之后，该手术才成为治疗终末期肺部疾病的临床现实。然而，发病率和死亡率仍然很高，肺移植受者的生存率低于其他实体器官移植受者，5年生存率为55.6%。对于肺移植受者来说，感染是一个重要的并发症。它是第一年内最常见的死亡原因，与肺部感染相关的呼吸衰竭是术后入院期间死亡的主要原因。

2024-06-12 10:19:31 160

原创成功案例（IF=12.2）| 肠道代谢组、微生物组和脑功能的综合分析揭示了肠-脑轴在长寿中的作用

人类长寿是一种受遗传、环境等多种因素影响的复杂表型。近年来，肠道微生物群被认为是长寿的一个重要因素，如Akkermansia、Alisipes和Parabacteroides已被报道与长寿有关。此外，最近的一项研究表明，百岁老人的肠道微生物群表现出与年轻人相似的特征，移植长寿人群微生物群的小鼠表现出衰老标志物的减少，这表明改变的肠道微生物群在长寿中起着关键作用。然而，肠道微生物群在健康衰老中的作用机制尚不清楚。肠道微生物群可以通过多种机制影响宿主，其中一种机制涉及代谢物。

2024-06-03 15:48:45 159

原创最新研究发现，摄入鸡蛋、内脏等食物会加速中老年女性衰老

越来越多的研究表明，特定的生活方式，如地中海饮食、热量限制或其他多模式生活方式，能够减缓甚至逆转衰老。然而，关于能够直接加速或者逆转衰老生物过程的具体饮食习惯，目前仍知之甚少。

2024-05-27 16:57:00 304

原创成功案例（IF=7.4）| 代谢组+16s联合分析助力房颤代谢重构的潜在机制研究

心房颤动（AF）是临床上最常见的持续性心律失常，具有显著的发病率和死亡率。高龄是房颤发病率、患病率和进展最显著的危险因素。与年龄在50-59岁之间的参与者相比，80-89岁之间的参与者患房颤的风险增加了9.33倍。目前尚不确定增龄性房颤的衰老是不良预后的决定因素，还是潜在进展性底物的标志物。因此，对增龄性房颤的深入了解仍值得期待。

2024-05-20 15:37:08 680

原创成功案例（IF=7.4）| 脂代谢组学和蛋白质组学分析揭示多囊卵巢综合征的发病机制

多囊卵巢综合征（PCOS）是女性最常见的内分泌和代谢紊乱，也是无排卵性不孕症和高雄激素血症的主要原因。患者的主要临床表现为月经少、不孕、高雄激素血症、肥胖、多毛、痤疮、胰岛素抵抗（IR）和B超下多囊卵巢改变。严重的代谢紊乱可导致PCOS的长期并发症，包括糖尿病、高脂血症、心血管疾病，甚至子宫内膜癌。脂质代谢组学和蛋白质组学是系统生物学中旨在发现疾病中的代谢途径变化和诊断生物标志物的新学科。

2024-05-13 09:40:14 230

原创成功案例（IF=7.3）| 转录组+蛋白质组+代谢组联合分析分析揭示胰腺癌中TAM2相关的糖酵解和丙酮酸代谢重构

胰腺癌（PAAD）是一种预后不良、死亡率高的恶性肿瘤。肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的大量浸润是PAAD的一个显著特征。TAMs可与胰腺癌细胞相互作用，调节代谢、炎症和免疫状态，形成免疫抑制TME，最终促进肿瘤的发生和发展。研究表明，巨噬细胞会影响胰腺癌细胞的生物学功能，如葡萄糖代谢。然而，目前仍缺乏一种结合TAM和代谢相关特征来识别PAAD新分子亚型的方法。代谢亚型为新一代癌症治疗的患者分类提供了一个独特的视角，因此，根据免疫代谢特性开发新的分子亚型对提高精准医疗至关重要。

2024-05-06 14:47:57 451

原创大熊猫“七仔”为什么是棕色的？最新研究揭示：这可能由一个基因突变导致

大熊猫是最具魅力的旗舰物种之一，其毛发特征是其引人注目的黑色和白色（以下简称黑熊猫）。但是在中国陕西省秦岭地区发现的棕色大熊猫推翻了人们的传统认知。自1985年第一只棕色大熊猫被发现以来，新闻已报道了11例记录。雄性棕色熊猫“七仔”是目前唯一一只圈养的棕色熊猫。棕色熊猫的反复出现意味着这种特征可能是可遗传的。

2024-04-28 09:22:33 1015

原创减少50%寿命！广东医科大学发现长期摄入反式脂肪酸会加速衰老并缩短寿命

根据世界卫生组织的数据，全球预期寿命已经超过74岁，近几十年来呈持续上升趋势。预期寿命延长导致老年人慢性疾病的发生率升高，特别是与肥胖相关的疾病。肥胖和衰老的结合显著增加了Ⅱ型糖尿病、心血管疾病和某些癌症的发病风险。肥胖和衰老对机体具有相似的表型，表现为线粒体功能受损、细胞内大分子积聚以及组织和身体成分的改变。高热量饮食，尤其是富含饱和脂肪酸和反式脂肪酸的饮食，是导致肥胖的重要原因。然而，TFA（反式脂肪酸）因其便利性、长保质期和增强风味等特点而广泛用于人类食品中。

2024-04-22 10:40:26 435

原创《柳叶刀》子刊：突破性临床试验，证实粪菌移植治疗帕金森病的潜力

帕金森病（Parkinson’s Disease，PD），是一种复杂的神经退行性疾病，也是世界上第二常见的神经退行性疾病，仅次于阿尔茨海默病（AD），影响着约1%-2%的65岁及以上老人。随着全球人口老龄化，帕金森病患病率还将大幅增加。目前，全世界有超过600万人患有帕金森病，每年还有约60000名新患者确诊。患者大脑中产生多巴胺的神经元丧失，影响运动和认知，导致出现震颤、肌肉僵硬、意识模糊和痴呆等症状。

2024-04-15 14:43:25 903

原创成功案例（IF=13.263）| 基因组+重测序+GWAS揭示豇豆传播过程中基因组的变化及荚果相关性状的遗传调控关键位点

豇豆（Vigna unguiculata (L.) Walp.），豆科的一员，是一种一年生的热带或亚热带草本植物，用于人类食物和动物饲料，作为青粪、干草或青贮饲料。有两种主要栽培亚种Vigna unguiculata ssp. sesquipedalis（长豇豆）和Vigna unguiculata ssp. unguiculata（普通豇豆）。前者主要在亚洲种植，以食用鲜嫩豆荚为主，后者主要在非洲种植，以食用籽粒为主。但是，豇豆缺乏高质量的染色体参考参考基因组，此外，长豇豆和普通豇豆之间也缺乏基因组比较。

2024-04-08 09:05:56 463

原创合作文章（IF=12.8）|宏基因组测序助力黑水虻富集活性污泥重金属调控机制的研究

我国每年各类污水活性污泥年产生量超7000万吨，尤其是富含铅（Pb）、砷（As）等相关重金属，暴露于高水平的Pb和As可诱发贫血、皮肤损伤、神经系统疾病和癌症。整体环境风险高，而且处理难度大。黑水牤幼虫（BSFL）能有效地将食物废弃物和污水活性污泥转化为蛋白质饲料和有机肥，为鱼、家禽和植物提供提供优质的营养。但是在黑水牤消化污水活性污泥的过程中，铅（Pb）和砷（As）的积累和转化情况尚不清楚。

2024-04-01 14:51:42 843

原创成功案例|全基因组测序+GWAS联合分析揭示不同种族帕金森病的遗传同质性和异质性

帕金森病（PD）是一种常见的与年龄相关的神经退行性疾病，其特征是运动迟缓、姿势不稳定、僵硬和静息性震颤。临床表现包括非运动症状，如认知功能障碍、自主神经功能障碍、睡眠障碍、抑郁和睡眠功能减退。在中国，到2030年，PD患者的人数预计将达到494万人，占全球病例的一半。帕金森病的确切病因尚不清楚，但遗传因素、环境因素和衰老在帕金森病的发病机制中起着重要作用。

2024-03-25 16:07:48 420

原创合作文章（IF=5.6）|16s+RNA-seq+短链脂肪酸检测揭示丁酸梭菌缓解食粪预防兔肠道炎症的新机制

兔子摄取软性粪便是一种具有营养意义的生理习惯，可提供氨基酸、维生素和其他不能被胃肠道有效吸收的营养物质。除了营养益处外，粪食还能稳定肠道微生物群和功能，这可能具有下游的生理效应，如维持能量稳态、免疫系统发育和认知功能。肠道微生物群和营养之间有广泛的相互作用，影响动物的生长性能和行为。然而，目前还没有科学证据表明食粪行为（Coprophagy prevention, CP）如何通过改变肠道菌群来影响生长性能。

2024-03-18 10:02:29 324

原创 Aging Cell：匈牙利学者发现肠道微生物组的变化和衰老密切相关

基于DNA甲基化衰老时钟的开发可以准确用来测量生物年龄，生物年龄在很大程度上受生活方式、环境和遗传等因素的影响，大量证据也表明健康生活方式可以延缓衰老并延长寿命。先前大规模微生物组分析表明，随着年龄的增长，微生物组菌群变得越来越独特。然而，微生物组与表观遗传衰老和身体健康之间的具体联系目前仍然未知。

2024-03-11 15:37:03 275

原创成功案例（IF=13.8）| 基因组de novo联合Hi-C组装萝卜高质量基因组

萝卜（Raphanus sativus L.）是世界范围内重要的根茎蔬菜作物。肉质主根是最重要的可食器官，提供了许多有益的营养物质，包括碳水化合物、矿物质、核黄素、植物化学物质和膳食纤维。然而，尽管萝卜具有生物学独特性和良好的营养价值，但其分子遗传学研究进展较其近缘作物要慢得多，这部分归因于迄今为止基因组组装和注释获得的信息有限。

2024-03-04 16:08:24 291

原创复旦大学最新研究发现，壳聚糖可延缓卵巢衰老

卵巢是哺乳动物的早期衰老器官之一，表现为卵泡数量减少，卵母细胞质量和数量下降。卵巢微环境中与年龄相关的变化与女性生育能力受损有关，巨噬细胞在卵巢组织稳态和免疫监视中起着重要作用。然而，衰老对卵巢巨噬细胞功能和卵巢稳态的影响尚不清楚。2024年1月27日，来自复旦大学妇产科医院的研究团队在Immunity & Ageing杂志发表题为“Chitosan alleviates ovarian aging by enhancing macrophage phagocyte-mediated tissue

2024-02-26 11:32:02 288

空空如也

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