求助！tophat报错

于 2020-12-10 15:58:21 发布
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分类专栏： 笔记
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小白一个，在进行rna-seq比对的时候使用tophat报错了，下载安装了samtools并移进了环境变量还是报错，实在搞不定了，有没有大神帮忙看看啊？谢谢谢谢谢谢

查到了，是我的samtools版本太高了，改成低版本（1.0以下）就好了

bx1103
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03-02 2845
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Error: Could not find Bowtie 2 index files 可能是这里错了
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02-23 6929
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07-14
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tophat变换matlab代码
02-27
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ec.rar_To the Top!
09-23
标题“ec.rar_To the Top!”暗示我们关注的焦点是一个名为"ec"的项目或系统，其核心在于提升性能或效率，达到了某种优化的顶峰。描述中的“顶级对象”指的是在软件架构中起主导作用的部分，它负责度量请求并把它们的...
top-hat.rar
06-09
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RNA-seq 流程、问题总结（一）
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关于Bowtie
xxxxy314的博客
10-06 1764
首先来说下以参考基因组建索引：下面是官网上的一个介绍 bowtie-build builds a Bowtie index from a set of DNA sequences. bowtie-build outputs a set of 6 files with suffixes .1.ebwt, .2.ebwt, .3.ebwt, .4.ebwt, .rev.1.ebwt, a
bowtie和samtools在tophat中的使用
宁生信
06-11 2978
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11-16 1万+
用conda安装bwa、samtools和tophat2 bwa $ conda install bwa samtools $ conda install samtools tophat2 安装 wget http://ccb.jhu.edu/software/tophat/downloads/tophat-2.1.0.Linux_x86_64.tar.gz 解压 tar -zxvf tophat-2.1.0.Linux_x86_64.tar.gz 加入环境变量path export
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python tophat
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