tophat常见错误

最新推荐文章于 2020-12-10 15:58:21 发布
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分类专栏： RNAseq
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转录组tophat2序列比对时遇到

Tophat Error : Couldn't build bowtie index with err = 1

如果是在不同网站上下载的染色体序列和基因gtf注释文件，就可能会出现错误。

所以下载数据时需要在同一网址下载，都在NCBI或者UCSC下载。

Tophat Error：gtf to fasta returned an error

这个时候要保证，下载的数据名称相同，一般序列文件第一行的gi号删除

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宁生信
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宁生信
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