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RSS订阅原创 Biopython根据关键词在NCBI上查找文献
Biopython是python的一个库，这个库可以解决很多生物上的问题，使大量的生物数据简单化，是个很好用的包。对于数据库上的各种信息，有专门的函数处理，不用按照常规的文本处理方法，写大量的代码。比如很常见的报告中展示的参考文献，一般思路是有了文章的PMID，然后通过爬虫的方法，获取这些文章的title，author，source等信息。在Biopython中有自己独特的解决方法。在NC...
2019-05-29 09:12:19
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原创 python解析gff文件中的转录本
1.下载基因组注释文件，选择对应的版本：ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/Homo_sapiens/ARCHIVE/BUILD.37.3/GFF/2.GTF 为General Transfer Format ，熟悉格式http://www.huoyunjn.com/wuliuxinwen/2/33709819.htm。第三列feature- 后面...
2019-05-27 13:47:10
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原创 pandas 读取文件时的设置header
用pandas 中的read_table()函数时，发现header设置值不一样，所获得的结果也不一样。之前一直认为header = 0 和header = None是一样的，其实是不一样的。读取一个有10行的文件，没有行名1.header =None 时，可以全部读取.2.header =0 时，少一行3.header =1 时，又少一行...
2019-05-17 17:26:26
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原创 下载百度文库的受限文件-冰点下载器
有时候找到一篇不错的文章，却只能看到一点内容，继续往下看，就要下载券，这时候可以用冰点文库下载。1.下载Fish-v323-0512软件，点击Fish.exe，免安装使用，出现如下界面：2.在选框中复制链接，点击下载，就可以看到下载进度条了。3.完成后在kpdf的文件夹下就可看到你要的文章了。...
2019-05-17 14:01:04
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空空如也
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