利用Biopython 快速根据pmid 来下载参考文献信息

之前用的常规爬虫思路（import requests，from bs4 import BeautifulSoup）来下载文章题目，作者，来源等信息时， 偶尔会出现各种问题，有那个调试的时间，就自己根据biopython快速写了一个脚本 ，简单好用。

# !bin/python
# encoding:utf-8

from Bio import Entrez
from  Bio  import Medline
Entrez.email = 'xxxx@qq.com'
ref = open('ref.txt','w+')
def downref(pmid):
    handle = Entrez.efetch(db="pubmed" , id=pmid , rettype="medline" , retmode="text")
    records = Medline.parse(handle)
    records = list(records) # records 是一个迭代器，所以只能访问这些records一次。如果想保存这些records，需要把他们转成列表。

    for record in records:
        print "title:" , record.get("TI" , "?")
        if len(record.get("AU" , "?"))>3: 
            author = ','.join(record.get("AU" , "?")[0:3]) #如果名字很多时，作者名字取前三个
            print