图机器学习(1)

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例如:第一章 Python 机器学习入门之pandas的使用


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前言

提示:这里可以添加本文要记录的大概内容:

图是描述大自然各种关联现象的通用语言,图无处不在。不同于传统数据分析中样本独立同分布假设,图数据自带了关联结构,需要使用专门的图神经网络进行深度学习。图数据挖掘的常见任务、典型方法、应用场景、编程工具。
斯坦福CS224W公开课介绍了在节点、连接、子图、全图各个层面进行图数据挖掘的典型任务,以及在蛋白质结构预测、生物医药、内容推荐、文献挖掘、社交网络、开源项目评价等领域的应用。


提示:以下是本篇文章正文内容,下面案例可供参考

一、图机器学习编程工具

PyG:www.pyg.org

NetworkX:networkx.org

DGL:www.dgl.ai

AntV图可视化工具Graphin:graphin.antv.vision

AntV图可视化工具G6:g6.antv.antgroup.com

Echarts可视化:echarts.apache.org/examples/zh/index.html#chart-type-graphGL

二、思考题

打开你的手机,里面那些APP用到了图机器学习和图神经网络的技术?(内容个性化推荐、社交网络、银行金融)
答:图机器学习和图神经网络可以应用在
社交网络:微信,Facebook
个性化推荐:淘宝,抖音,美团
搜索:谷歌,百度
银行金融:富途

A股、港股、美股市值最高的上市公司,哪些公司的核心资产是图?
答:阿里巴巴,腾讯,快手,美团

观看电影《社交网络》,图和图数据挖掘的商业价值体现在哪些方面?
答:有空再看

马化腾在2022年12月内部讲话提到,微信视频号是整个腾讯的希望,请从图的角度解释这句话。
答:当年的QQ游戏利用社交网络对联众游戏进行了降维打击。微信视频号也是利用社交属性,来对短视频进行推荐,发送和传播。

在你自己的研究领域,哪些数据可以用图或者网络来表示,如何进行图数据挖掘?
答:在汽车领域,每个零部件都是节点node,它与其他零件的关系可以看做是边edge,那么在整车生产中,可以根据关系来安排组装顺序,更合理的安排工序。在汽车维修中,可以通过知道某个零件的需求预测出相关零件的需求。
在材料研发中,每种原材料可以看做节点node,它和其他材料的关系可以看做edge,而材料之间的比例可以看做边的权重weight。

近年来,图数据挖掘在哪些领域带来了革命性进展?
答:图数据挖掘在蛋白质结构预测方面做出了革命性的进展。为制药学提供了基础和依据。

图数据挖掘解决哪些基本任务?
答:解决了各个节点之间并非独立,而是有关联的问题。

分别从图、连接、节点三个层面,举例解释图数据挖掘在生物医学方面的应用。
答:氨基酸就是节点,氨基酸之间的作用就是连接,节点和连接组成了肽,多肽,蛋白质,就是图。

图神经网络为什么是端到端的?为什么不需要人工做特征工程?
答:图神经网络是一个黑盒。中间有激活函数,正则,dropout。可以自动学习到特征,不需要人工干预。把node变成d维向量。

图神经网络和其它神经网络有什么区别?
答:全连接神经网络,卷积神经网络cs231,循环神经网络cs224n,Transformer 和图神经网络cs224w的区别。
卷积神经网络处理图像数据,独立同分布。
循环神经网络,Transformer处理语音,文本数据,带有前后顺序的序列数据。
全连接神经网络处理表格数据。
图神经网络处理节点和连接的图数据。

简述AlphaFold的基本原理,它解决了哪些以前解决不了的问题?
答:通过氨基酸(一级元素)预测蛋白质(三级元素)的空间结构。

图机器学习和传统机器学习有什么区别和难点?
答:图机器学习解决了数据之间的联系。传统机器学习要求数据独立同分布。

图机器学习的编程工具有哪些?看看它们的官网吧(Graphgym、pyG、networkx、dgl、Pytorch、AntV、Echarts)
答:好的
Graphgym

三、思考题2

举几个Heherogeneous Graph(异质图)的例子
答:包含不同种类的节点和边。例如:疾病-药物-生产厂家

异质图和普通图有什么区别?
答:节点和关系的种类更加丰富。

举几个Bipartite Graph(二分图)的例子
答:用户和商品。

举几个有向图的例子
答:交通图,交易买卖图,

如何设计本体图Ontology?
答:根据需求和目标来设计

为什么要把图表示成矩阵?
答:方便表示node 和 edge

如何从连通域的角度,理解“六度空间”理论:世界上任意两个人,可以通过不超过六个中间人,相互认识。
答:

为什么很多真实场景的图都是稀疏的?
答:因为连接不是直接的,大多数是间接的。


总结

提示:这里对文章进行总结:

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