R包安装记录

chen3673

于 2024-05-28 09:47:21 发布

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文章标签： r语言开发语言

本文链接：https://blog.csdn.net/chen3673/article/details/139255864

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记录R包安装

#BiocManager官方给定的国内镜像源地址
https://bioconductor.org/about/mirrors/

#安装 devtools 和 BiocManager
if (!requireNamespace("devtools", quietly = TRUE)) install.packages("devtools")
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager")
#Devtools 从githup上面安装软件
devtools::install_github("GreenleafLab/ArchR", ref="master", repos = BiocManager::repositories())
#devtools 离线安装软件
devtools::install_local('C:/Users/79414/Downloads/ArchR-master/ArchR.zip', repos = NULL,)
#设置BiocManager的国内镜像源
options(BioC_mirror="https://mirrors.westlake.edu.cn/bioconductor")
#BiocManager安装软件
BiocManager::install("SummarizedExperiment")
#R包的安装软件方法
install.packages("SummarizedExperiment")