BiocManager的镜像源设置

背景

最近，在使用Docker构建镜像时，由于网络的问题，总是断断续续的进行，导致构建一个镜像需要花费很长的时间。

解决办法

首先，想到的是构建镜像源

• 永久设置

# Bioconductor 设置为清华镜像
# 在Home目录下增加/修改.Rprofile文件（或在$R_HOME/etc下增加Rprofile.site文件），
# 在文件最后加上镜像设置：
options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")
# 或者
# Bioconductor设置为中科大的镜像
options(BioC_mirror="http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")

# CRAN设置成清华大学的镜像
options(repos = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))

• 短暂设置
  在执行命令前，执行上述命令。