记录贴：python mri 图像显示

已于 2024-03-16 16:58:51 修改
阅读量482 收藏 5
点赞数 16
文章标签： python 开发语言
于 2024-03-16 16:50:47 首次发布
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/cococili0/article/details/136765337
版权

1、NiBabel安装

pip install nibabel

 注意：第一次安装发生报错 将加速器关闭后安装成功

2、mri图像显示

单层

#data processing
test_load = nib.load('文件位置').get_fdata()
test_load.shape
test = test_load[:,:,59]#选择位置
plt.imshow(test)
plt.show()

多层

test_load = nib.load('文件位置').get_fdata()
for i in range(5):
    plt.subplot(5, 5,i + 1)
    plt.imshow(test_load[:,:,59 + i])
    plt.gcf().set_size_inches(10, 10)
plt.show()

3、ITK-SNAP软件显示mri图像

http://www.itksnap.org/pmwiki/pmwiki.php

官网下载 无脑安装 

软件安装成功后导入图像 完成显示

时间：2024.3.16 截至目前有效

cococili0
关注
  • 16
    点赞
  • 踩
  • 5
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 1
    评论
iDIO：Diffusion MRI 标准化处理工具箱
ImageFlow的博客
03-05 222
3组数据的采集参数如表1所示。扩散磁共振成像( diffusion magnetic resonance imaging，dMRI )是研究人脑白质纤维特性和结构网络的主要无创性活体成像技术，如基于体素的扩散张量参数(例如,各向异性分数和平均扩散系数)的基于纤维束的空间统计，或基于纤维束成像的分析来测量复杂人脑组织的拓扑特性。( S1 )原始输入图像，( S2 )噪声去除，( S3 )Gibbs去除，( S4 )信号漂移校正，( S5 )磁化率导致影像扭曲、涡流畸变和主体运动校正，( S6 )偏置场校正。
python数字图像处理：图像简单滤波
01-27
对图像进行滤波，可以有两种效果：一种是平滑滤波，用来抑制噪声；另一种是微分算子，可以用来检测边缘和特征提取。skimage库中通过filters模块进行滤波操作。1、sobel算子sobel算子可用来检测边缘函数格式为：...
python显示磁共振图像（MRI）（pydicom）
qq_37804582的博客
09-27 3537
介绍：MRI是多参数成像，其成像参数主要包括T1 、T2和质子密度等。在MRI检查中，可分别获取同一解剖部位或层面的T1WI、T2WI、PDWI等多种图像，从而有利于显示正常组织与病变组织。而包括CT在内的X线成像，只有密度一个参数，仅能获得密度对比一种图像。在MRI中，T1加权图像(T1WI)上的影像对比主要反映的是组织问T1的差别；T2加图像(T2WI)上的影像对比主要反映的是组织间T2的差别；PDWI上的影像对比主要反映的是组织间质子密度的差别。这种多参数成像有利于组织性质的确定。例如，在CT图像中，
【深度学习】: 脑部MRI图像分割
chen695969的博客
02-07 1843
本次案例将使用深度学习技术来完成脑部MRI(磁共振)图像分割任务，即对于处理好的一张MRI图像，通过神经网络分割出其中病变的区域。本次案例使用的数据集来自Kaggle[1]，共包含110位病人的MRI数据，每位病人对应多张通道数为3的.tif格式图像，其对应的分割结果为单通道黑白图像(白色为病变区域)
【深度学习】脑部MRI图像分割
你一定能够成为你想要去成为的人。
03-05 3289
本次案例将使用深度学习技术来完成脑部MRI(磁共振)图像分割任务，即对于处理好的一张MRI图像，通过神经网络分割出其中病变的区域。本次案例使用的数据集来自Kaggle[1]，共包含110位病人的MRI数据，每位病人对应多张通道数为3的.tif格式图像，其对应的分割结果为单通道黑白图像(白色为病变区域)，示例如下。第一行: MRI图像；第二行: 对应的分割标签更详细的背景介绍请参考文献[2]​ 对比所有模型结果的训练、测试的loss曲线与测试集上的DSC曲线，结果如下。
python与医学图像处理
qq_23100417的博客
11-30 7367
最近刚开始看脑影像方面的内容，感谢博主们的分享！ python与医疗图像1 https://blog.csdn.net/ssw_1990/article/details/51890055 python与医疗图像2https://blog.csdn.net/ssw_1990/article/details/51996011 python与医疗图像3https://blog.csdn.n...
学习记录（四）：医学图像配准使用到的代码。
YA！的博客
07-09 3236
1.python以三视图形式显示三维.nii格式医学图像 import nibabel as nib from nibabel.viewers import OrthoSlicer3D file = nib.load("path") #将.nii格式图像读入 OrthoSlicer3D(file.dataobj).show() 2.对图像进行裁剪（.nii格式） import numpy as np import nibabel as nib file = nib.load("path") #将
肺实质分割python实现
qq_43318971的博客
10-23 2092
肺实质分割python实现 最近在做医学图像处理项目，是一个分类任务，输入是肺部CT图像，看到好多大佬的第一步都是肺实质分割，减少噪声。经过几天的努力终于实现了，在这里做一个简单的记录。 找代码的时候发现好多都是用 Matlab 传统方法实现的，效果也很不错。但是项目是python的，只好舍弃继续找，终于在github上找到了一个大佬的开源代码： https://github.com/JoHof/lungmask 实现时注意的一些点：输入是dcm格式的图像，输出png 分割效果如下图所示： 此时得到的m
【Python】matplotlib.pyplot显示图片
qq_37804582的博客
03-13 9809
import matplotlib.pyplot as plt plt.axis("off") # 不显示刻度 1.figure语法及操作 (1)figure语法说明 figure(num=None, figsize=None, dpi=None, facecolor=None, edgecolor=None, frameon=True) num:图像编号或名称，数字为编号 ，字符串为名称 figsize:指定figure的宽和高，单位为英寸； dpi:参数指定绘图对象的分辨率，即每英寸多少个像素.
使用 pyradiomics 进行医学影像学图像的特征提取
weixin_44324447的博客
05-27 1553
使用pyradiomics包进行医学影像学图像（主要是nrrd格式）做特征值提取。对比了原 Github 库中存在的 issues、releases 以及一些中文转载的文档中，没有提到的却切实存在的相关问题，比如 MSVC 环境的配置方法，给出了切实可行的解决方案。
IMEncrypt:Python 图像加密
07-05
Python 图像加密 - 自述文件 作者： Cahlen Humphreys (phku) 电子邮件： 感谢：#blacksun on eris free 和 Tilar。 描述： 一个完全用python编写的简单图像加密程序。 您只需运行程序“python imencrypt.py”...
pydeface:用于MRI图像的涂饰工具
05-03
一种从MRI图像中去除面部结构的工具。 依存关系： 包裹 测试版 6.0.2 3.7.3 1.17.1 2.5.1 1.3.0-rc1 安装 pip install pydeface 或者 git clone https://github.com/poldracklab/pydeface.git cd pydeface ...
imageboard:Python Flask图像板
04-16
图像板Python Flask图像板
imagehash：Python感知图像哈希模块
02-05
imagehash：Python感知图像哈希模块
每日一题——Python实现PAT乙级1042 字符统计（举一反三+思想解读+逐步优化）
weixin_44915521的博客
06-09 968
这些编程思想和哲学理念在编写高效、健壮的代码时至关重要。通过理解和应用这些原则，我们不仅能够写出性能更好的代码，还能在不同情况下做出更加明智的设计决策。通过理解和应用这些哲学和编程思想，可以在不同场景中灵活运用，写出更加高效、健壮和灵活的代码。评估需求：根据实际需求选择最合适的数据结构和算法。避免冗余：尽量避免不必要的重复计算和操作。权衡利弊：在空间和时间之间找到最佳平衡点。灵活应变：根据输入数据的特性，灵活使用动态数据结构和提前决策策略。
htb_Blurry
weixin_62621015的博客
06-13 355
hack the box linux
GLM+vLLM 部署调用
最新发布
qq_38915354的博客
06-13 520
vLLM 框架是一个高效的大型语言模型（LLM）推理和部署服务系统
python opencv图像显示
10-11
要在Python中使用OpenCV显示图像，你可以按照以下步骤进行操作： 1. 首先，确保你已经安装了OpenCV库。你可以使用以下命令安装： ``` pip install opencv-python ``` 2. 导入OpenCV库： ```python import cv2 ``` 3. 使用`cv2.imread()`函数加载图像。该函数接受图像文件的路径作为参数并返回一个表示图像的Numpy数组： ```python image = cv2.imread('image.jpg') ``` 4. 使用`cv2.imshow()`函数显示图像。该函数接受两个参数：窗口名称和要显示的图像。你可以使用`cv2.waitKey()`函数来等待用户关闭窗口： ```python cv2.imshow('Image', image) cv2.waitKey(0) ``` 5. 最后，使用`cv2.destroyAllWindows()`函数关闭所有打开的窗口： ```python cv2.destroyAllWindows() ``` 以下是一个完整的示例代码： ```python import cv2 image = cv2.imread('image.jpg') cv2.imshow('Image', image) cv2.waitKey(0) cv2.destroyAllWindows() ``` 请注意，图像文件应与你的Python脚本位于相同的目录中，或者你需要提供正确的文件路径。 希望这可以帮助到你！如果你有其他问题，请随时问我。

“相关推荐”对你有帮助么？

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
评论 1
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值