c# 绘图 数据科学
尽管Python和R之类的语言在数据科学中越来越受欢迎，但是C和C ++对于高效的数据科学而言是一个不错的选择。 在本文中，我们将使用C99和C ++ 11编写一个使用Anscombe的四重奏数据集的程序，接下来我将对其进行解释。
我在一篇涉及Python和GNU Octave的文章中写了我不断学习语言的动机，值得回顾。 所有程序都应在命令行上运行，而不是通过图形用户界面 （GUI）运行。 完整的示例可在polyglot_fit信息库中找到 。
编程任务
您将在本系列中编写的程序：
- 从CSV文件读取数据
- 用直线内插数据（即f（x）= m⋅x + q ）
- 将结果绘制到图像文件
这是许多数据科学家遇到的普遍情况。 示例数据是Anscombe四重奏的第一组，如下表所示。 这是一组人工构造的数据，当拟合直线时可以提供相同的结果，但是它们的曲线非常不同。 数据文件是一个文本文件，其中的制表符用作列分隔符，几行作为标题。 该任务将仅使用第一组（即前两列）。
| 一世 | II | 三级 | IV | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| x | ÿ | X | ÿ | X | ÿ | X | ÿ |
| 10.0 | 8.04 | 10.0 | 9.14 | 10.0 | 7.46 | 8.0 | 6.58 |
| 8.0 | 6.95 | 8.0 | 8.14 | 8.0 | 6.77 | 8.0 | 5.76 |
| 13.0 | 7.58 | 13.0 | 8.74 | 13.0 | 12.74 | 8.0 | 7.71 |
| 9.0 | 8.81 | 9.0 | 8.77 | 9.0 | 7.11 | 8.0 | 8.84 |
| 11.0 | 8.33 | 11.0 | 9.26 | 11.0 | 7.81 | 8.0 | 8.47 |
| 14.0 | 9.96 | 14.0 | 8.10 | 14.0 | 8.84 | 8.0 | 7.04 |
| 6.0 | 7.24 | 6.0 | 6.13 | 6.0 | 6.08 | 8.0 | 5.25 |
| 4.0 | 4.26 | 4.0 | 3.10 | 4.0 | 5.39 | 19.0 | 12.50 |
| 12.0 | 10.84 | 12.0 | 9.13 | 12.0 | 8.15 | 8.0 | 5.56 |
| 7.0 | 4.82 | 7.0 | 7.26 | 7.0 | 6.42 | 8.0 | 7.91 |
| 5.0 | 5.68 | 5.0 | 4.74 | 5.0 | 5.73 | 8.0 | 6.89 |
C方式
C是一种通用编程语言，是当今使用最广泛的语言之一（根据TIOBE索引 ， RedMonk编程语言排名 ， 编程语言索引的流行度和GitHub的八度状态提供的数据 ）。 它是一种非常古老的语言（大约在1973年），并且用它编写了许多成功的程序（例如，Linux内核和Git仅举两个例子）。 它也是最接近计算机内部运行的语言之一，因为它直接用于操作内存。 它是一种编译语言 ; 因此，源代码必须由编译器翻译为机器代码 。 它的标准库很小，功能很少，因此开发了其他库来提供缺少的功能。
我最常使用数字处理数字 ，主要是因为它的性能。 我觉得使用起来很麻烦，因为它需要很多样板代码 ，但是在各种环境中都得到了很好的支持。 C99标准是最新版本，增加了一些漂亮的功能，并且受到编译器的良好支持。
我将一路介绍C和C ++编程的必要背景，以便初学者和高级用户都可以继续学习。
安装
要使用C99进行开发，您需要一个编译器。 我通常使用Clang ，但是GCC是另一个有效的开源编译器。 对于线性拟合，我选择使用GNU科学库 。 对于绘图，我找不到任何明智的库，因此该程序依赖于外部程序： Gnuplot 。 该示例还使用动态数据结构来存储数据，该结构在Berkeley Software Distribution （BSD）中定义。
在Fedora中安装就像运行一样容易：
sudo dnf install clang gnuplot gsl gsl-devel
注释码
在C99中，通过将//放在行的开头来格式化注释 ，其余行将被解释器丢弃。 另外， / *和* /之间的任何内容也将被丢弃。
// This is a comment ignored by the interpreter.
/* Also this is ignored */
必要的图书馆
库由两部分组成：
- 头文件 ，其中包含功能说明
- 包含函数定义的源文件
头文件包含在源文件中，而库的源文件与可执行文件链接 。 因此，此示例所需的头文件是：
// Input/Output utilities
#include <stdio.h>
// The standard library
#include <stdlib.h>
// String manipulation utilities
#include <string.h>
// BSD queue
#include <sys/queue.h>
// GSL scientific utilities
#include <gsl/gsl_fit.h>
#include <gsl/gsl_statistics_double.h>
主功能
在C语言中，程序必须位于名为main（）的特殊函数内：
int main
(
void
)
{
...
}
这与上一教程中介绍的Python不同，后者将运行在源文件中找到的任何代码。
定义变量
在C语言中，变量必须在使用前声明，并且必须与类型相关联。 每当您要使用变量时，都必须决定要在其中存储哪种数据。 您也可以指定是否打算将变量用作常量值，这不是必需的，但是编译器可以从此信息中受益。 从存储库中的fitting_C99.c程序 ：
const
char
* input_file_name
=
"anscombe.csv"
;
const
char
* delimiter
=
" \t "
;
const
unsigned
int skip_header
=
3
;
const
unsigned
int column_x
=
0
;
const
unsigned
int column_y
=
1
;
const
char
* output_file_name
=
"fit_C99.csv"
;
const
unsigned
int N
=
100
;
C中的数组不是动态的，因为它们的长度必须预先确定（即，在编译之前）：
int data_array [ 1024 ] ;
由于您通常不知道文件中有多少个数据点，因此请使用单链列表 。 这是一个动态数据结构，可以无限增长。 幸运的是，BSD 提供了链接列表 。 这是一个示例定义：
struct data_point
{
double x
;
double y
;
SLIST_ENTRY
( data_point
) entries
;
}
;
SLIST_HEAD
( data_list
, data_point
) head
= SLIST_HEAD_INITIALIZER
( head
)
;
SLIST_INIT
(
& head
)
;
本示例定义了一个data_point列表，该列表由同时包含x值和y值的结构化值组成。 语法相当复杂，但很直观，详细描述它可能太冗长。
打印输出
要在终端上打印，可以使用printf（）函数，其功能类似于Octave的printf（）函数（在第一篇文章中介绍）：
printf ( "#### Anscombe's first set with C99 #### \n " ) ;
printf（）函数不会在打印字符串的末尾自动添加换行符，因此您必须添加它。 第一个参数是一个字符串，可以包含其他可以传递给函数的参数的格式信息，例如：
printf ( "Slope: %f \n " , slope ) ;
读取数据
现在来了困难的部分……有一些C语言用于CSV文件解析的库，但是似乎没有一个稳定或流行的库足以存在于Fedora软件包存储库中。 我没有为本教程添加依赖项，而是决定自己编写此部分。 同样，进入细节太罗word了，所以我只解释总体思路。 为了简洁起见，将忽略源代码中的某些行，但是您可以在存储库中找到完整的示例。
首先，打开输入文件：
FILE * input_file = fopen ( input_file_name , "r" ) ;
然后逐行读取文件，直到出现错误或文件结束：
getline（）函数是POSIX.1-2008标准的一个很好的新增功能。 它可以读取文件中的整行，并负责分配必要的内存。 然后使用strtok（）函数将每一行拆分为令牌 。 遍历令牌，选择所需的列：
最后，当选择了x和y值时，将新数据点插入到链表中：
struct data_point
* datum
=
malloc
(
sizeof
(
struct data_point
)
)
;
datum
-> x
= x
;
datum
-> y
= y
;
SLIST_INSERT_HEAD
(
& head
, datum
, entries
)
;
malloc（）函数为新数据点动态分配（保留）一些持久性内存。
拟合数据
GSL线性拟合函数gsl_fit_linear（）需要简单的数组作为其输入。 因此，由于您将不知道创建的数组的大小，因此必须手动分配它们的内存：
然后，遍历链接列表以将相关数据保存到数组：
SLIST_FOREACH
( datum
,
& head
, entries
)
{
const
double current_x
= datum
-> x
;
const
double current_y
= datum
-> y
;
x
[ i
]
= current_x
;
y
[ i
]
= current_y
;
i
+=
1
;
}
现在您已经完成了链接列表，请清理它。 始终释放已手动分配的内存，以防止内存泄漏 。 内存泄漏是坏的，坏的，坏的。 每次不释放内存时，花园侏儒都会迷失自己的头：
while
(
! SLIST_EMPTY
(
& head
)
)
{
struct data_point
* datum
= SLIST_FIRST
(
& head
)
;
SLIST_REMOVE_HEAD
(
& head
, entries
)
;
free
( datum
)
;
}
最后，finally（！），您可以适合您的数据：
gsl_fit_linear
( x
,
1
, y
,
1
, entries_number
,
& intercept
,
& slope
,
& cov00
,
& cov01
,
& cov11
,
& chi_squared
)
;
const
double r_value
= gsl_stats_correlation
( x
,
1
, y
,
1
, entries_number
)
;
printf
(
"Slope: %f \n "
, slope
)
;
printf
(
"Intercept: %f \n "
, intercept
)
;
printf
(
"Correlation coefficient: %f \n "
, r_value
)
;
绘图
您必须使用外部程序进行绘图。 因此，将拟合函数保存到外部文件：
const
double step_x
=
(
( max_x
+
1
)
-
( min_x
-
1
)
)
/ N
;
for
(
unsigned
int i
=
0
; i
< N
; i
+=
1
)
{
const
double current_x
=
( min_x
-
1
)
+ step_x
* i
;
const
double current_y
= intercept
+ slope
* current_x
;
fprintf
( output_file
,
"%f \t %f \n "
, current_x
, current_y
)
;
}
用于绘制两个文件的Gnuplot命令是：
plot 'fit_C99.csv' using 1 : 2 with lines title 'Fit' , 'anscombe.csv' using 1 : 2 with points pointtype 7 title 'Data'
结果
在运行程序之前，必须对其进行编译：
clang - std = c99 - I / usr / include / fitting_C99. c - L / usr / lib / - L / usr / lib64 / - lgsl - lgslcblas - o fitting_C99
该命令告诉编译器使用C99标准，读取fitting_C99.c文件，加载库gsl和gslcblas ，然后将结果保存到fit_C99 。 命令行上的结果输出为：
#### Anscombe's first set with C99 ####
Slope:
0.500091
Intercept:
3.000091
Correlation coefficient:
0.816421
这是用Gnuplot生成的结果图像。
C ++ 11方式
C ++是一种通用编程语言，也是当今使用的最受欢迎的语言之一。 它是C的继承人 （于1983年创建），重点是面向对象的编程 （OOP）。 C ++通常被视为C的超集，因此C程序应该能够使用C ++编译器进行编译。 这并非完全正确，因为在某些极端情况下它们的行为有所不同。 以我的经验，C ++比C需要更少的样板，但是如果要开发对象，语法会更困难。 C ++ 11标准是最新版本，增加了一些漂亮的功能，并且或多或少受编译器支持。
由于C ++在很大程度上与C兼容，因此我只强调两者之间的差异。 如果我在本部分中没有涵盖任何部分，则意味着它与C中的相同。
安装
C ++示例的依赖项与C示例相同。 在Fedora上，运行：
sudo dnf install clang gnuplot gsl gsl-devel
必要的图书馆
库的工作方式与C中的相同，但是include指令略有不同：
#include <cstdlib>
#include <cstring>
#include <iostream>
#include <fstream>
#include <string>
#include <vector>
#include <algorithm>
extern
"C"
{
#include <gsl/gsl_fit.h>
#include <gsl/gsl_statistics_double.h>
}
由于GSL库是用C编写的，因此您必须将这种特殊性告知编译器。
定义变量
C ++比C支持更多的数据类型（类），例如比C具有更多功能的字符串类型。 相应地更新变量的定义：
const std :: string input_file_name ( "anscombe.csv" ) ;
对于字符串之类的结构化对象，可以不使用=符号来定义变量。
打印输出
您可以使用printf（）函数，但是cout对象更惯用了。 使用运算符<<表示要使用cout打印的字符串（或对象）：
std
::
cout
<<
"#### Anscombe's first set with C++11 ####"
<< std
::
endl
;
...
std
::
cout
<<
"Slope: "
<< slope
<< std
::
endl
;
std
::
cout
<<
"Intercept: "
<< intercept
<< std
::
endl
;
std
::
cout
<<
"Correlation coefficient: "
<< r_value
<< std
::
endl
;
读取数据
该方案与以前相同。 将打开文件并逐行读取文件，但语法不同：
std
::
ifstream input_file
( input_file_name
)
;
while
( input_file.
good
(
)
)
{
std
::
string line
;
getline
( input_file, line
)
;
...
}
使用与C99示例相同的功能提取行令牌。 代替使用标准C数组，请使用两个向量 。 向量是C ++标准库中C数组的扩展，它允许动态管理内存而无需显式调用malloc（） ：
std
::
vector
<
double
> x
;
std
::
vector
<
double
> y
;
// Adding an element to x and y:
x.
emplace_back
( value
)
;
y.
emplace_back
( value
)
;
拟合数据
为了适合C ++，您不必遍历列表，因为可以保证向量具有连续的内存。 您可以将向量缓冲区的指针直接传递给拟合函数：
gsl_fit_linear
( x.
data
(
) ,
1 , y.
data
(
) ,
1 , entries_number,
& intercept,
& slope,
& cov00,
& cov01,
& cov11,
& chi_squared
)
;
const
double r_value
= gsl_stats_correlation
( x.
data
(
) ,
1 , y.
data
(
) ,
1 , entries_number
)
;
std
::
cout
<<
"Slope: "
<< slope
<< std
::
endl
;
std
::
cout
<<
"Intercept: "
<< intercept
<< std
::
endl
;
std
::
cout
<<
"Correlation coefficient: "
<< r_value
<< std
::
endl
;
绘图
使用与以前相同的方法进行绘图。 写入文件：
const
double step_x
=
(
( max_x
+
1
)
-
( min_x
-
1
)
)
/ N
;
for
(
unsigned
int i
=
0
; i
< N
; i
+
=
1
)
{
const
double current_x
=
( min_x
-
1
)
+ step_x
* i
;
const
double current_y
= intercept
+ slope
* current_x
;
output_file
<< current_x
<<
" \t "
<< current_y
<< std
::
endl
;
}
output_file.
close
(
)
;
然后使用Gnuplot进行绘图。
结果
在运行程序之前，必须使用类似的命令对其进行编译：
clang ++ - std = c ++ 11 - I / usr / include / fitting_Cpp11. cpp - L / usr / lib / - L / usr / lib64 / - lgsl - lgslcblas - o fitting_Cpp11
命令行上的结果输出为：
#### Anscombe's first set with C++11 ####
Slope:
0.500091
Intercept:
3.00009
Correlation coefficient:
0.816421
这就是用Gnuplot生成的结果图像。
结论
GObject和Jansson库。对于数字运算，我更喜欢在C99中工作，因为它的语法更简单并且得到了广泛的支持。 直到最近，C ++ 11还没有得到广泛的支持，我倾向于避免使用先前版本中的粗糙边缘。 对于更复杂的软件，C ++可能是一个不错的选择。
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