生物信息数据分析学习项目

最新推荐文章于 2024-11-02 09:29:53 发布
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分类专栏： 笔记 文章标签： 数据挖掘 人工智能 数据分析 python
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/cxldbbv/article/details/131396586
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文章列举了适合生物信息数据分析初学者的四个GitHub项目，包括BioProteinAnalyze、deepvariant、gemBS和snsxt，同时推荐了两本Python相关的生物信息学电子书供学习参考。
摘要由CSDN通过智能技术生成

由于研究生方向为生物信息数据分析挖掘，整理了几个生物信息数据分析初学研读的github项目：
1.https://gitee.com/chen-xianglong006/BioProteinAnalyze180420.git
2.https://gitee.com/chen-xianglong006/deepvariant.git
3.https://gitee.com/chen-xianglong006/gemBS.git
4.https://gitee.com/chen-xianglong006/snsxt.git

顺便推荐几个利用python搞生物信息数据分析的电子书：
（1）Python for Bioinformatics
链接：https://u062.com/file/18113597-374223764
（2）Bioinformatics with Python
链接：https://u062.com/file/18113597-374231984

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python做生物信息学分析_Python从零开始第五章生物信息学①提取差异基因
weixin_34737066的博客
03-02 4453
目前来说，做生物信息学的人越来越多，但是我觉得目前而言做生信的主要有三类人：老本行是做实验的，做生信可能是为了辅助研究或者是为了发paper(有非常多的临床生选择趟生信这波水)主要是做生信的，主要涵盖高通量测序数据分析，组学数据分析等等，专门从事生物学数据分析的这群人，其大部分也是本科生物狗作为强大的生力军，以调包写R，python为主。那么这群人就要熟悉看各种包的tutorial以及如何进行常规...
计算生物学习——Code_PyTorch(06.15-06.19)
weixin_43213559的博客
06-19 964
计算生物学习笔记1
数据分析实例：生物信息学数据分析
AI天才研究院
01-25 1509
1.背景介绍 生物信息学是一门跨学科的领域，它结合了生物学、计算机科学、数学、化学等多个领域的知识和技术，为生物研究提供了强大的支持。生物信息学数据分析是生物信息学领域中的一个重要部分，它涉及到对生物数据的收集、存储、处理、分析和挖掘。在本文中，我们将从以下几个方面进行阐述： 背景介绍 核心概念与联系 核心算法原理和具体操作步骤以及数学模型公式详细讲解 具体最佳实践：代码实例和详细解释说明 ...
计算机毕业设计之基于深度学习的生物数据分析与可视化
2401_85506100的博客
06-20 267
前台vue的页面主要页面包括数据可视化展示页面，爬虫模块主要用来爬取网站的相关数据信息的，通过使用MySQL进行数据的存储，django后台用来提供前台所用的json数据以及给出推荐的相关的基于深度学习的生物数据分析与可视化系统的设计与实现系统和用户行为信息。其中基于深度学习的生物数据分析与可视化系统和用户行为预测模块的实现是基于机器学习功能之后的应用阶段。随着生物数据的爆炸式增长，如何有效地挖掘和分析这些数据，将其转化为可视化的形式以帮助科研人员发现数据中的规律和价值，成为当前生物信息学研究的重要课题。
机器学习_深度学习毕设题目汇总——数据分析_数据挖掘
MetaGrad的博客
02-08 1万+
下面是该类的一些题目： 题目 基于大数据分析的市场精准描述与预测 基于可调Q因子小波变换和迁移学习的脑电数据分析方法研究 基于深度学习的烟草近红外光谱数据分析 基于自回归模型和机器学习的大气电场数据分析和应用研究 基于可视化技术的音乐数据分析平台的研究 面向数据分析的探索式服务组合推荐技术研究 基于深度学习的神经精神性狼疮早期诊断模型和医疗数据分析研究 某区域大电网高压继电保护文本缺陷数据分析及应用研究 基于大数据分析的电站锅炉性能预测及优化 多线圈电磁加
生信入门：探索生物信息学的奇妙世界
灵舒的博客
07-23 540
生物信息学是一个不断发展和创新的领域，它要求学习者不仅具备扎实的生物学基础，还要掌握计算机编程、统计学等多学科知识。通过不断的实践和学习，您将能够在这个充满挑战与机遇的领域中找到自己的位置，为解决生命科学中的重大问题贡献力量。希望这篇入门文章能够激发您对生物信息学的兴趣，并为您的学习之旅提供一个良好的起点。
国家微生物科学数据中心推出免费一站式生物信息分析云平台
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
12-16 1970
产生了大量的微生物组学数据，想进行数据分析不知道使用什么工具？不会使用Linux系统？不会写代码？没有合适的参考数据库？计算资源不足？现在这些问题都可以通过国家微生物数据中...
2024年值得收藏的AI数据分析工具
sexy19910923的博客
09-15 2061
人工智能（AI）数据分析工具正变得越来越重要，通过自然语言处理、机器学习和高级数据可视化技术，使数据探索、分析和决策过程变得更加高效和直观。
数据分析之数据预处理、分析建模、可视化
热门推荐
若如初见
08-08 10万+
概述：简介、思路、发展历程、应用领域、开发流程； 数据类型：结构化与非结构化、定性与定量、截面数据与时间序列数据； 数据来源：外部来源、内部来源； 数据预处理：数据清洗、数据集成、数据规约、数据变换； 数据分析模型：对比分析、漏斗分析、留存分析、A/B测试、用户行为路径分析、用户分群、用户画像分析等； 数据分析方法：描述统计、假设检验、信度分析、相关分析、方差分析、回归分析、聚类分析、判别分析、主成分分析、因子分析、时间序列分析等； 数据可视化：Excel、PowerBI、Tableau、Python；
呆瓜半小时入门python数据分析_金融和生物信息学多个实战案例
fulk6667g78o8的专栏
12-13 2928
随着数据经济到来，数据分析师成为一门性感职业。在互联网时代，我们每个人的信息，行为，通信，衣食住行都被数据化，存储在数据中心里。通过数据分析，我们可以从数据库里得到有价值信息。因此大数据正成为Google，Facebook，Twitter，百度，腾讯，阿里等跨国公司的核心财富。（下图为facebook位于欧洲的数据中心）数据驱动经济，各行各业对数据分析师需求越来越大，其中互联网行业，金融行业，电子商务行业，计算机行业，移动互联网行业对数据分析需求量特别大，是典型行业。（下图为2000条数据抽样统计结论）小公
生物医学数据分析中的深度学习方法应用.pdf
02-14
生物医学数据分析是近年来随着大数据技术发展迅速的领域，其中深度学习作为一种先进的机器学习技术，在处理高通量组学数据、临床数据挖掘等方面展现了巨大的潜力。深度学习方法是从人工神经网络发展而来，通过非线性...
基于R语言的数据分析项目.zip
01-08
R语言作为一种强大的统计计算和图形生成工具，被广泛应用于数据挖掘、机器学习、生物信息学等多个领域。下面将详细探讨R语言在数据分析中的关键知识点。 1. **数据导入与管理**：R语言提供了多种库，如`readr`、`...
基于深度学习的近红外光谱数据回归分析模型项目源码.zip
10-27
基于深度学习的近红外光谱数据回归分析模型项目源码.zip基于深度学习的近红外光谱数据回归分析模型项目源码.zip基于深度学习的近红外光谱数据回归分析模型项目源码.zip基于深度学习的近红外光谱数据回归分析模型项目...
生物信息学在大数据分析中的挑战.pptx
06-03
### 生物信息学在大数据分析中的挑战 #### 海量数据的存储和管理挑战 - **数据规模与多样性**：生物信息学领域的数据主要包括基因组序列、转录组数据及蛋白质组数据等，这些数据不仅数量庞大，而且类型多样、结构...
生物医学数据分析中的深度学习方法应用
03-07
在生物数据分析中，深度学习模型被用于基因序列分析，帮助发现疾病相关的基因变异。然而，在这些应用中，数据处理、模型构建和训练方法等方面仍存在共同的问题，如数据的高维度、不平衡性和复杂性，模型的过拟合、欠...
数据挖掘（五）
最新发布
快乐江小鱼的博客
11-02 627
不是所有数据集都是用特征来表示的，数据集可以使一位作家写的全部书籍，也可以是电影胶片，还可以是馆藏的历史文物。实物的复杂性对目前的算法来说太过复杂，我们可以使用简洁的模型来表示实物。建模过程中需要对真实世界中的对象进行简化，这样会导致信息的丢失，这就是为什么没有一套能够用于任何数据集的通用的数据挖掘方法。我们要关注如何用模型来表示现实，多考虑数据挖掘的目标，而不是轻率地用我们过去用过的特征。数据集可以是用特征来描述的，可以使交易类型的数据，此外还有其他数据集，比如文本、图像、声音、视频甚至是真实的物体。
提升项目预算控制能力的实用建议
xgggyxgs的博客
10-30 489
在项目管理中，预算估计的准确性直接影响项目的成功与否。要改进预算估计不准确的问题，可以从以下几个方面入手：充分的需求分析、历史数据的利用、团队协作的加强、风险管理的实施、持续的监控与调整。其中，充分的需求分析是确保预算估计准确性的基础。通过详细了解项目的需求和范围，可以有效避免由于需求变更或遗漏导致的预算偏差。
大数据-204 数据挖掘 机器学习理论 - 混淆矩阵 sklearn 决策树算法评价
永远好奇，无限进步！
11-02 1222
也就是说，单纯的追求捕捉少数类，就会成本太高，而不顾及少数类，又会无法达成模型的效果。比如银行在判断一个申请信用卡的客户是否会违约行为的时候，如果一个客户被判断为会违约，这个客户的信用卡申请就会驳回，如果为了捕捉会违约的人，大量地将不会违约的客户判断为会违约的客户，就会有许多无辜的客户的申请被驳回。基于混淆矩阵，我们有一系列不同的模型评估指标，这些评估指标范围都在【0，1】之间，所以有11 和 00为分子的指标都是越来越接近 1 越好，所以 01 和 10 为分子的指标都是越来越接近 0 越好。
大数据-203 数据挖掘 机器学习理论 - 决策树 sklearn 剪枝参数 样本不均匀问题
永远好奇，无限进步！
11-02 847
剪枝参数一定能够提升模型在测试集上的表现吗？调参是没有绝对的答案的，一切都需要看数据的本身。无论如何，剪枝参数的默认值会让树无尽的生长，这些树在某些数据集上可能非常巨大，对内存的消耗也非常巨大。属性是模型训练之后，能够调用查看的模型的各种性质，对决策树来说，最重要的是 feature_importances，能够查看各个特征对模型的重要性。
研究数据分析项目：renrenche洞察
资源摘要信息:"数据分析项目study1" 数据分析项目"study1"涉及的关键词为"数据分析"，这表示该文件或文件集的内容可能涉及数据分析相关的理论、方法、技术或实践案例。 1. 数据分析概述： 数据分析是指通过统计学...
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