光谱解混的问题,目的是通过三通道的测量来重建每种荧光beads的光谱。
有confocal三个通道拍摄的三张荧光beads图片用于参考。
图像在空间(x, y)上捕捉了荧光beads的强度,每种beads都有其特定的荧光光谱响应,以ground truth(GT1, GT2, GT3)来表示(每个光谱通道λ上的值分别是GT1、GT2和GT3),可以把这三个值看作是每个图像在每个像素点上的“强度”。
A(x,y,λ), B(x,y,λ),C(x,y,λ)=GT1,GT2,GT3
"Ground truth"(GT)是一个术语,通常用于描述数据的真实或确切状态,通常作为基准或标准来检查模型的性能或预测的准确性。此处GT1、GT2、GT3分别代表三种荧光beads在光谱中的真实响应或强度。
A、B、C矩阵代表在每个像素位置(x, y)和每个光谱通道λ的荧光强度。每个光谱通道λ,A、B、C的所有像素强度都被设置为相应的GT1、GT2、GT3。
因为光谱图像不仅包含了空间信息(即像素的位置信息x和y),还包含了光谱信息(即在各个光谱通道上的强度值)。
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1.首先,创建了三个空的三维矩阵A、B、C,它们的大小都是512x512x1024。512x512对应于像素的空间尺寸,1024对应于光谱通道的数量。
A = zeros(512, 512, 1024);
B = zeros(512, 512, 1024);
C =