Daisy4的博客

RuntimeError: CUDA error: no kernel image is available for execution on the deviceOSError: /home/aita/anaconda3/envs/FusionDTA/lib/python3.7/site-packages/nvidia/cublas/lib/libcublas.so.11: symbol cublasLtHSHMatmulAlgoInit version libcublasLt.so.11 not de

平常数据一般下到本地然后上传到服务器，但是内存告急，想起来之前用命令行下载数据，写了2行代码搞定。

在调试代码时报错：python key of type tuple not found and not a MultiIndex

tensor与numpy、array的转换，针对RuntimeError: Can‘t call numpy() on Variable that requires grad问题

安装或调用python3,biopython。python2 里面用的module是。python3 里用的module是。

ERROR: Could not install packages due to an OSError: [Errno 2] 没有那个文件或目录: '../lib/python3.7/site-packages/numpy-1.21.6.dist-info/METADATA'找到目录也就是：/lib/python3.7/site-packages/numpy-1.21.6.dist-info，然后创建一个文件METADTATA。

No module named 'gensim' 和 Read timed out

matlab 处理数据将.mat转.txt，代码如下clear allload('MixPA.mat')T=cell2table(protein_A); #数据集里面有个名字writetable(T,'Mix.AC_P1.txt');我应该集齐了所有文件转换处理的方法，摸摸自己，今天又是洒泪的一天，嘿嘿嘿……#########################写代码头秃的分割线系统说我质量较低，我应该再写点废话。我是一个菜鸟，挣扎在毕业一线，还有3年毕业，每天担心毕业到头秃，

处理数据信息需要使用不同的软件，python与matlab共同处理数据，以下是使用matlab将.txt和.csv文件转为.mat文件的代码：clc;close all;clear all;cancerPA=importdata('cancerPA.txt') #.csv就直接输入 X.csv就行save cancerPA.mat cancerPA;至此，python的文件转换，matlab的文件转换都差不多经历了，期待与大家的交流。...

对.txt文件，经过处理提取之后，存为.txt文件，可以采用以下代码：file_1 = '/cancer_fasta_PA.txt' #读取的.txt文件file_3 = '/cancerPA.txt' #要保存的.txt文件# positive seq protein Apos_seq_protein_A = read_file(file_1) #这里的读取是前一个文章写的outfile1=open(file_3,'w')#方法一for line in po

数据集通常需要去掉文件中的重复行，以下是操作代码：

数据处理尝尝需要把数据集从.txt转到.csv格式，可以通过以下代码完成：import numpy as npimport pandas as pdimport csv out = open('/LF1big.csv','w',newline='') #要转成的.csv文件，先创建一个LF1big.csv文件 csv_writer = csv.writer(out,dialect='excel') f = open("/LF1.txt","r") for line

1.Keras框架需要用到Lambda函数keras.layers.Lambda(function, output_shape=None, mask=None, arguments=None)function:函数，分割用到的是tf.splitoutput_shape:输出维度，下面代码是分成2块，在num_or_size_splits决定axis=2，感觉是按列分；axis=1，是按照行分；axis=0，请求大家评论区补充from keras.layers import Lambd

#####unique# -*- coding:utf-8 -*-#! python2import shutila=0readDir = "/Wnt/Wnt_proteinname.txt" #oldwriteDir = "/Wnt/Wnt_proteinnameunique.txt" #newlines_seen = set()outfile = open(writeDir, "w")f = open(readDir, "r")for line in f: if line n.

def fenhang(infile,outfile,outfile1): infopen = open(infile,'r',encoding='utf-8') outopen = open(outfile,'w',encoding='utf-8') outopen1 = open(outfile1, 'w', encoding='utf-8') lines = infopen.readlines() i = 0 for line in lines: i += 1 if i % .

tensor转numpy： x.numpy()a = torch.ones(5)print(a) ##输出：tensor([1., 1., 1., 1., 1.])转换：b = a.numpy()print(b) ##输出：[1. 1. 1. 1. 1.]numpy转tensor： torch.from_numpy(x)import numpy as npa = np.ones(5)b = torch.from_numpy(a)np.add(a, 1, out

下载的Xshell不需要卸载哦~1）去Xhell官方网站：XSHELL - NetSarang Website2）找到最下面点击3）填写邮箱4 得到两封邮件，安装然后发现可以打开了，而且许可类型是家庭/学校:用这种方式有一个大好处就是不需要卸载xshell，就可以直接把商业版转换成免费版，最最主要的是如果你的xshell里面仍然保存之前的IP。xshell评估过期解决办法，非常简单_芯想事程的博客-CSDN博客_xshell过期了怎么办...

在运行代码时，经常需要查看某数字的维度，即X.shape，当X时list时，不能查看其维度信息，所以转换如下List转Numpy：numpy.array(list)Numpy转List：array.tolist()

使用Keras训练了一个模型，训练好后保存为h5文件。再次加载这个模型时，报错了：AttributeError: ‘str‘ object has no attribute ‘decode‘ “原因： h5py包的版本不对导致使用的python为3.6，conda list查看到h5py版本为3.1.0，更新版本为pip install h5py==2.10问题解决...

re.sub()用来替换字符串中的匹配项函数具体为：def sub(pattern, repl, string, count=0, flags=0): """Return the string obtained by replacing the leftmost non-overlapping occurrences of the pattern in string by the replacement repl. repl can be either a string

代码来自Self attention：自注意力——Keras，IMDB 数据 - 知乎# %%import pandas as pdfrom keras import backend as Kfrom keras.datasets import imdbfrom keras.engine.topology import Layerfrom keras.preprocessing import sequencefrom matplotlib import pyplot as plt#

整理list数据使其输出为.csv，但是由于数据过大，所以现在前面截出几行，取list前5行代码为：###我的list命名为lll,取前4行lll = lll[0:4]然后调用一个pd.DataFrame转换，该方法有多个参数，这里由于我对横纵坐标没有特殊要求，所以只输出数字： lll = pd.DataFrame(data=lll) lll.to_csv('/home/LX/data_method/AC.csv',encoding='gbk')...

百度到的是在终端输入ls -a，将出现的 .pyc文件删除。但是操作后并没有出现，此时发现代码文件有一个 utils，将里面所有 .pyc文件删除，OK。总结，如果是numpy、random等已有的包，一定是 ls -a删除，如果是代码文件可以考虑删除文件里面的 .pyc!...

在报错后首先使用了pip install psutil安装失败，使用conda list查看没有改为pip install --upgrade psutilOK，get it

在将多个.csv合并之后输出结果是添加了一行标签，其个数是dim，数据类型是文件类型，具体如下图之前的代码是import pandas as pddf1 = pd.read_csv(r'/home/LX/DNN_XGB/Dataset/csv/AAC_N1.csv', header=None)#读取第一个文件df2 = pd.read_csv(r'/home/LX/DNN_XGB/Dataset/csv/CT_N1.csv', header=None)#读取第二个文件df3 = .

在读取.csv时发现会产生第一行默认为标签的问题，导致出现下图情况这是因为pd.read_csv，读取数据时会默认第一行为列标签，并将相同的列标签重复的次数以.N的形式统计出现，解决方法是，在读取时加入参数，使第一行为非标签行。给pd.read_csv添加参数header=none即可df1 = pd.read_csv(r'/home/LX/DNN_XGB/Dataset/csv/AAC_N1.csv', header=None)#读取第一个文件...

添加列1）在最后添加df = pd.DataFrame({'num_legs': [2, 4, 8, 0], 'num_wings': [2, 0, 0, 0], 'num_specimen_seen': [10, 2, 1, 8]}, index=['falcon', 'dog', 'spider', 'fish'])print(df)df['rank']=[1,2,3,4]#添

DataFrame.sampleDataFrame.sample方法主要是用来对DataFrame进行简单随机抽样的。PS：这里说的是简单随机抽样，表示是不能用来进行系统抽样、分层抽样的。DataFrame.sample这个方法可以从DataFrame中随机抽取行，也可以随机抽取列，这个方法接收的参数如下：DataFrame.sample(n=None, frac=None, replace=False, weights=None, random_state=None, axis

代码能力太差，时间紧迫，纯看代码，把遇到问题和觉得有意思的地方写下来……import pandas as pdimport numpy as npdf = pd.DataFrame({ 'col1' : ['A', 'A', 'B', np.nan, 'D', 'C'], 'col2' : [2, 1, 9, np.nan, 7, np.nan], 'col3' : [0, 1, 9, 4, 2, 3]})print(df)输出 col1 col2 col30 A